8
วิเคราะห์ข้อมูลโครงสร้างโปรตีนใน C
พื้นหลังของฉันอยู่ในฟังก์ชั่นจีโนม แต่เมื่อเร็ว ๆ นี้ฉันได้ทำงานกับปัญหาที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างโปรตีน ฉันเขียนโปรแกรมที่เกี่ยวข้องใน C สร้างตัวแยกวิเคราะห์ไฟล์ PDB ของตัวเองตั้งแต่เริ่มต้น ฉันไม่ต้องกังวลกับการแยกวิเคราะห์ที่แข็งแกร่งจริง ๆ ฉันเพิ่งรู้ว่าการสร้างตัวเองจะเป็นวิธีที่ดีที่สุดในการบังคับตัวเองให้เข้าใจรูปแบบ PDB ตอนนี้ฉันได้ผ่านขั้นตอนนี้แล้วฉันกำลังมองหาบางสิ่งที่แข็งแกร่งและเป็นผู้ใหญ่มากกว่านี้ มีไลบรารีโครงสร้างโปรตีนโอเพนซอร์ซที่ถูกใช้งานใน C หรือไม่? ฉันสามารถค้นหาบางอย่างบน Google แต่ฉันไม่เคยได้ยินเกี่ยวกับพวกเขามาก่อนและดูเหมือนว่าพวกเขาจะไม่โตเต็มที่หรือมั่นคง คำถามที่เกี่ยวข้องเล็กน้อย: ทุกคนกำลังทำการคำนวณประเภทนี้ทั้งหมดโดยใช้ Python หรือไม่? หรือรหัส homebrew? PS ฉันกำลังมองหาไลบรารี่ที่มีตัวแยกวิเคราะห์ไฟล์ PDB, ฟังก์ชั่นสำหรับการคำนวณมุมบอนด์, ความยาวบอนด์, มุมแรงบิด, พื้นที่ผิวที่สามารถเข้าถึงพื้นผิวได้ ฯลฯ