การประมวลผลภาพ - การนับนิวเคลียส

ฉันกำลังพยายามสร้างโปรแกรมที่สามารถนับจำนวนนิวเคลียสในภาพ:

สิ่งที่ฉันทำไปแล้วคือขั้นตอนต่อไปนี้:

1. ใช้ Alternating Sequential Filter (การปิดและเปิดภาพด้วยองค์ประกอบโครงสร้างที่ใหญ่ขึ้นเรื่อย ๆ )
2. ใช้การแปลงระยะทาง
3. ใช้การแบ่งส่วนลุ่มน้ำโดยใช้ภาพแปลงระยะทางในการตรวจจับขั้นต่ำ

ซึ่งให้ผลลัพธ์ต่อไปนี้ (โดยที่แต่ละสีแสดงถึงนิวเคลียสใหม่นับ):

อย่างที่เราเห็นมีความไม่สมบูรณ์จำนวนมากโดยเฉพาะนิวเคลียสที่มากเกินไป ฉันจะบอกว่าเหตุผลของปัญหานั้นคือวิธีที่ฉันกำหนดขั้นต่ำสำหรับการแปลงลุ่มน้ำ (โดยใช้การแปลงระยะทาง) แต่ฉันไม่มีความคิดอื่น ๆ สำหรับการกำหนดขอบเขตขั้นต่ำในกรณีนั้น

เมื่อการแปลงระยะทางสร้างขั้นตอนน้อยที่สุดตามความกลมของวัตถุฉันต้องการทราบทางเลือกที่ดีกว่าในการปัดเศษนิวเคลียสมากกว่าตัวกรองสลับลำดับ (ดูที่ภาพด้านบนเราสามารถอนุมานได้ว่า "เกิน" ส่วนใหญ่มาจาก นิวเคลียสที่โค้งมนน้อยลง) ฉันต้องการทราบวิธีที่ดีกว่าในการกำหนดให้ minima สำหรับการแปลงลุ่มน้ำ

มีบทความมากมายเกี่ยวกับวิธีจัดการกับปัญหา oversegmentation ของลุ่มน้ำ แต่ฉันคิดว่าคุณควรอ่านวิธีการแบ่งส่วนภาพเซลล์ที่แข็งแกร่ง (บทความวิทยาศาสตร์จากปี 2004 โดย Bengtsson et al)

มันครอบคลุมวิธีการต่าง ๆ สำหรับการแบ่งส่วนภาพเซลล์และรวมถึงตัวอย่างจริงของโลกที่แสดงวิธีจัดการ oversegmentation จากสันปันน้ำในภาพกล้องจุลทรรศน์เรืองแสงคล้ายกับของคุณ มันใช้เมล็ดจากการแปลงระยะทางคล้ายกับวิธีการของคุณและผสานภูมิภาคที่มีเส้นขอบอ่อน บทความอ่านได้ดีและแนวคิดค่อนข้างตรงไปตรงมาเพื่อนำมาใช้ใน Matlab

สำหรับแนวทางที่เป็นปัจจุบันมากขึ้นคุณสามารถอ่านA Decomposition Scheme สำหรับวัตถุ 3D Fuzzy บนพื้นฐานของข้อมูลระยะทางฟัซซี่โดย Svensson มันใช้วิธีการที่คล้ายกันเช่นเดียวกับใน Bengtsson et al แต่ทำงานในการแปลงระยะทางคลุมเครือซึ่งให้ความหนาแน่นที่ดีขึ้นสำหรับวัตถุที่ใช้ในบทความ

คุณสามารถลอง "การแปลงรูปขยายสูงสุด" ซึ่งเป็นวิธีการสร้างใหม่ทางสัณฐานวิทยา มันตรวจจับคะแนนสูงสุดที่ให้เกณฑ์ความคมชัดซึ่งคุณสามารถคว่ำและกำหนด มันถูกนำมาใช้ใน Matlab