การทำให้เป็นมาตรฐานของ Quantile ทำงานอย่างไร?

ในการศึกษาการแสดงออกของยีนโดยใช้ microarrays ข้อมูลความเข้มจะต้องเป็นมาตรฐานเพื่อให้ความเข้มสามารถเปรียบเทียบระหว่างบุคคลระหว่างยีน แนวคิดและอัลกอริทึมทำงาน "การทำให้เป็นมาตรฐานของควอไทล์" ได้อย่างไรและคุณจะอธิบายสิ่งนี้กับนักสถิติได้อย่างไร

genetics normalization microarray

— สตีเฟ่นเทอร์เนอร์
แหล่งที่มา

เรียบง่าย: มันคือ "การให้เกรดบนเส้นโค้ง" :-) ฉันให้อัลกอริทึมที่quantdec.com/envstats/notes/class_03/probability.htm ("การอ่านแปลง QQ")

— whuber

PDF นี้อธิบายการทำให้เป็นมาตรฐานแบบควอนไทด์ด้วยตัวอย่างการทำงานอย่างง่าย: plexdb.org/modules/documentation/RMAexplained.pdfกระดาษกำลังอธิบายกระบวนการที่มีขนาดใหญ่ขึ้น (RMA) แต่การทำ normalization normalization จะดำเนินการเป็นหนึ่งในขั้นตอนหนึ่ง

— JHubbard80

การเปรียบเทียบวิธีการทำให้เป็นมาตรฐานสำหรับข้อมูลอาร์เรย์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ความหนาแน่นสูงขึ้นอยู่กับความแปรปรวนและอคติโดย Bolstad และคณะ แนะนำ quantization normalization สำหรับ data array และเปรียบเทียบกับวิธีอื่น มีคำอธิบายอัลกอริทึมที่ชัดเจน

$j$ $\hat{F}^{-1} \circ \hat{G}_j$ $\hat{G}_j$ $\hat{F}^{-1}$ $\hat{G}_j$ $j$ $\hat{F}$

ในตอนท้ายของวันมันเป็นวิธีการในการเปลี่ยนอาร์เรย์ทั้งหมดเพื่อให้มีการกระจายความเข้มทั่วไป

— NRH
แหล่งที่มา