วิธีที่ดีที่สุดในการโต้ตอบกับเซสชัน R ที่ทำงานในคลาวด์

ฉันมี R ทำงานบน EC2 Amazon, ใช้รุ่นแก้ไขของBioconductor AMI ขณะนี้ฉันกำลังใช้ putty เพื่อ ssh ในเซิร์ฟเวอร์ของฉันเริ่มต้น R จากบรรทัดคำสั่งแล้วคัดลอกและวางสคริปต์ของฉันจาก notepad ++ ลงในเซสชั่นฉาบของฉัน

สิ่งคือฉันเกลียดการตัดและวาง รู้สึกถึงยุคหินและบางครั้งฉันก็มีปัญหาเรื่องบัฟเฟอร์ที่ทำให้รหัสของฉันผิดพลาด ฉันไม่สามารถใช้RStudioเพราะมันไม่รองรับมัลติคอร์ซึ่งขึ้นอยู่กับฉัน

วิธีที่สง่างามกว่านี้คืออะไร?

/ แก้ไข: ขอบคุณสำหรับคำแนะนำที่ดีทั้งหมด สำหรับตอนนี้ฉันได้เปลี่ยนไปใช้ foreach กับแบ็กเอนด์ doRedis ซึ่งใช้งานได้ดีกับ Mac, PC ของฉันและ amazon ผ่าน RStudio สวิตช์นี้ค่อนข้างง่ายเมื่อฉันเรียนรู้วิธีเขียนฟังก์ชันที่เลียนแบบ "lapply"โดยใช้ "foreach" (นอกจากนี้ doRedis ยอดเยี่ยมมาก!)

ฉันสามารถคิดได้หลายวิธี ฉันทำสิ่งนี้ไปไม่นานและนี่คือวิธีที่ฉันพบว่ามีประโยชน์มากที่สุด:

1. โหมด Emacs ภูต ssh เข้าสู่อินสแตนซ์ EC2 ด้วยสวิตช์ -X ดังนั้นจึงส่งต่อหน้าต่าง X กลับไปที่เครื่องลบของคุณ การใช้โหมด daemon จะทำให้แน่ใจได้ว่าคุณจะไม่สูญเสียสถานะหากการเชื่อมต่อของคุณหมดเวลาหรือลดลง
2. แทนที่จะใช้แพคเกจมัลติคอร์ให้ใช้แบ็กเอนด์แบบขนานอื่นกับแพ็คเกจ foreach ด้วยวิธีนี้คุณสามารถใช้ RStudio ซึ่งยอดเยี่ยม Foreach นั้นยอดเยี่ยมเพราะคุณสามารถทดสอบโค้ดของคุณแบบไม่ขนานแล้วสลับไปที่โหมดขนานโดยเพียงแค่เปลี่ยนแบ็กเอนด์ของคุณ (1 หรือ 2 บรรทัดของโค้ด) ฉันแนะนำแบ็กเอนด์ doRedis คุณอยู่ในคลาวด์และอาจทำให้เครื่องจักรหลายเครื่อง!

วิธีที่สะดวกที่สุดคือเพียงติดตั้งเซิร์ฟเวอร์ VNC และสภาพแวดล้อมแบบแสงบางอย่างเช่น XFCE และสร้างเซสชันเสมือนที่คุณสามารถใช้จากที่ใดก็ได้ที่คุณต้องการ

สินค้าเพิ่มเติมคือคุณสามารถใช้คลิปบอร์ดท้องถิ่นของคุณในเดสก์ท็อปเสมือนและดูวิธีแปลง R เร็วกว่าการส่งต่อ X11 หรือคัดลอกไฟล์ภาพ

มันต้องใช้ความพยายามในการตั้งค่าทุกอย่างถูกต้อง (X init, ssh tunnel) แต่อินเทอร์เน็ตเต็มไปด้วยบทเรียนเกี่ยวกับวิธีการนั้น

ฉันไม่รู้ว่า Amazon EC2 ทำงานอย่างไรบางทีโซลูชันที่เรียบง่ายของฉันอาจไม่ทำงาน แต่ปกติฉันใช้ scp หรือ sftp (ผ่าน WinSCP ถ้าฉันใช้ Windows) หรือ git

ฉันจะใช้ rsync เพื่อส่งสคริปต์และไฟล์ข้อมูลไปยังเซิร์ฟเวอร์จากนั้น "nohup Rscript myscript.R> output.out &" เพื่อเรียกใช้สิ่งต่าง ๆ และเมื่อเสร็จแล้ว rsync เพื่อดึงผลลัพธ์

VIM + tmux + VIM Slime คุณได้รับตัวแก้ไขข้อความที่ยิ่งใหญ่ที่สุดและความสามารถในการส่งรหัสจากตัวแก้ไขไปยังบรรทัดคำสั่ง R (เหมือนกับใน Rstudio)

ผมใช้ R สตูดิโอบน EC2 ตลอดเวลาขอบคุณที่AMI s ที่สร้างขึ้นโดยหลุยส์ Aslett คุณไม่จำเป็นต้องรู้ SSH หรืออะไร (นอกเหนือจาก R แน่นอน) คุณเพียงแค่ต้องการบัญชี EC2 ดังที่กล่าวไว้ในหนึ่งในคำตอบอื่น ๆ R Studio สนับสนุนการคำนวณแบบขนานผ่านทางแพคเกจforeach สิ่งนี้ทำให้สามารถควบคุมพลังของ EC2 ได้อย่างแท้จริง ด้วยการใช้อินสแตนซ์ที่ปรับปรุงการคำนวณ (32 คอร์) ทำให้ฉันสามารถลดเวลาการฝึกอบรมสำหรับรุ่น ML ของฉันได้อย่างไม่มีค่าใช้จ่าย (เกือบสองสามเหรียญต่อชั่วโมง)