ฉันกำลังติดตามหลักสูตรเกี่ยวกับสถิติแบบเบย์โดยใช้ BUGS และ R ตอนนี้ฉันรู้แล้วว่า BUGS มันเยี่ยมมาก แต่ฉันไม่ชอบการใช้โปรแกรมแยกต่างหากแทนที่จะเป็นอาร์
ฉันได้อ่านแล้วว่ามีแพ็คเกจ Bayesian ใหม่จำนวนมากใน R. มีรายการหรือการอ้างอิงว่ามีแพ็คเกจใดบ้างสำหรับสถิติ Bayesian และสิ่งเหล่านี้มีอะไรบ้าง และมีแพ็คเกจ R ที่เป็นทางเลือกสำหรับความยืดหยุ่นของ BUGS หรือไม่?
คำตอบ:
คุณสามารถดูแพ็คเกจMCMCglmmที่มาพร้อมกับบทความสั้น ๆ ที่ดีมาก นอกจากนี้ยังมีbayesglm()ฟังก์ชั่นสำหรับการปรับโมเดลเชิงเส้นแบบเบย์ทั่วไปในแพ็คเกจแขนโดย Andrew Gelman ฉันยังได้ยินเกี่ยวกับการเปิดตัว blmer / bglmerฟังก์ชั่นในอนาคตสำหรับการสร้างแบบจำลองลำดับชั้นในแพ็คเกจเดียวกัน
มีบางคนที่ฉันรู้จักใช้JAGSอยู่ ไวยากรณ์ JAGS คล้ายกับ BUGS
มุมมองภารกิจที่สองของ Bayesian ฉันแค่เพิ่มคะแนนสำหรับMCMCpackซึ่งเป็นแพ็คเกจสำหรับผู้ใหญ่ที่มีหลากหลายรุ่น ส่วนใหญ่เอกสารค่อนข้างดีเกินไป
ประสิทธิภาพเป็นเหตุผลหลักที่ผู้ใช้ใช้ WinBUGS / OpenBUGS / JAGS เทียบกับแพ็คเกจเช่น MCMglmm มันเป็นเรื่องยากมากที่ไม่ปฏิบัติในการเขียนตัวอย่างกิ๊บส์ที่มีประสิทธิภาพในอาร์เนทีฟมีแพ็กเกจที่ช่วยให้คุณทำงานรุ่น BUGS จากสคริปต์ R ให้บริการสะดุดตาRBUGSและBUGSParallel
MCMCglammเป็นตัวอย่างที่ไม่ดีเพราะ "การจำลองแบบ [a] ll ทำใน C / C ++ โดยใช้ไลบรารี CSparse สำหรับระบบการกระจายเชิงเส้น" (ดูนามธรรม )