ความสัมพันธ์ Intraclass (ICC) สำหรับการโต้ตอบ?


22

สมมติว่าฉันมีการวัดสำหรับแต่ละเรื่องในแต่ละเว็บไซต์ ตัวแปรสองตัวคือหัวเรื่องและไซต์เป็นที่สนใจในแง่ของการคำนวณค่าความสัมพันธ์ภายในเซลล์ (ICC) โดยทั่วไปฉันจะใช้ฟังก์ชั่นlmerจากแพคเกจ R lme4และเรียกใช้

lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata)

ค่า ICC สามารถหาได้จากผลต่างสำหรับเอฟเฟกต์แบบสุ่มในโมเดลด้านบน

อย่างไรก็ตามเมื่อเร็ว ๆ นี้ฉันอ่านกระดาษที่ไขปริศนาตัวฉันจริงๆ จากตัวอย่างข้างต้นผู้เขียนคำนวณค่า ICC สามค่าในกระดาษพร้อมฟังก์ชั่น lme จากแพ็คเกจ nlme: หนึ่งค่าสำหรับหัวเรื่อง, หนึ่งค่าสำหรับไซต์และค่าหนึ่งสำหรับการโต้ตอบของหัวเรื่องและไซต์ ไม่มีการให้รายละเอียดเพิ่มเติมในเอกสาร ฉันสับสนจากสองมุมมองต่อไปนี้:

  1. จะคำนวณค่า ICC ด้วย lme ได้อย่างไร? ฉันไม่รู้วิธีระบุเอฟเฟกต์สุ่มทั้งสาม (หัวเรื่องไซต์และการโต้ตอบ) ใน lme
  2. การพิจารณา ICC เป็นเรื่องที่มีความหมายจริงๆหรือไม่สำหรับการโต้ตอบของหัวเรื่องและไซต์ จากการสร้างแบบจำลองหรือมุมมองทางทฤษฎีคุณสามารถคำนวณได้ แต่ในทางแนวคิดแล้วฉันมีปัญหาในการตีความการโต้ตอบดังกล่าว

นี่คือกระดาษ: bieegl.net/Publications/Papers/2010/…
bluepole

คำถามนี้มีการอธิบายอย่างชัดเจนถึงวิธีการคำนวณ ICC โดยใช้ R มากกว่าสิ่งอื่นใดที่ฉันพบในเว็บ อย่างไรก็ตามฉันต้องการรายละเอียดเพิ่มเติม มีผู้อ้างอิงเรื่องใดบ้าง
dfrankow

คำตอบ:


22

สูตรโมเดล R

lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata)

เหมาะกับรูปแบบ

Yijk=β0+ηi+θj+εijk

ที่เป็นk 'TH จากฉันที่J , η ฉันเป็นเรื่องที่ฉันผลสุ่มθ เจเป็นเว็บไซต์ผลสุ่มและε ฉันเจkเป็นข้อผิดพลาดที่เหลือ เอฟเฟกต์แบบสุ่มเหล่านี้มีความแปรปรวนσ 2 η , σ 2 θ , σ 2 εที่ประเมินโดยตัวแบบ (โปรดทราบว่าหากหัวเรื่องซ้อนอยู่ภายในไซต์คุณจะเขียนแบบดั้งเดิมθ i jYijkkmeasurementsubject isite jηiiθjjεijkση2,σθ2,σε2θijที่นี่แทน )θj

ในการตอบคำถามแรกของคุณเกี่ยวกับวิธีการคำนวณ ICCs:ภายใต้รุ่นนี้ ICCs เป็นสัดส่วนของความแปรปรวนทั้งหมดที่อธิบายโดยปัจจัยการบล็อกที่เกี่ยวข้อง โดยเฉพาะอย่างยิ่งความสัมพันธ์ระหว่างการสังเกตสองแบบที่เลือกแบบสุ่มในเรื่องเดียวกันคือ:

ICC(Subject)=ση2ση2+σθ2+σε2

ความสัมพันธ์ระหว่างการสังเกตสองแบบที่เลือกแบบสุ่มจากไซต์เดียวกันคือ:

ICC(Site)=σθ2ση2+σθ2+σε2

ความสัมพันธ์ระหว่างการสังเกตสองแบบที่เลือกแบบสุ่มในบุคคลเดียวกันและที่ไซต์เดียวกัน (การโต้ตอบแบบเรียกว่า ICC) คือ:

ICC(Subject/Site Interaction)=ση2+σθ2ση2+σθ2+σε2

ICCSubjectsite

แต่ละปริมาณเหล่านี้สามารถประมาณได้โดยเสียบเข้ากับการประมาณค่าความแปรปรวนเหล่านี้ที่ออกมาจากการปรับแบบจำลอง

ICCICC

Subject ICCSubjectsiteση2site


ขอบคุณมากสำหรับคำอธิบาย / คำอธิบาย! ใช่ความสับสนของฉันส่วนใหญ่เกี่ยวกับส่วนปฏิสัมพันธ์ ขอบคุณอีกครั้ง.
bluepole
โดยการใช้ไซต์ของเรา หมายความว่าคุณได้อ่านและทำความเข้าใจนโยบายคุกกี้และนโยบายความเป็นส่วนตัวของเราแล้ว
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.