การประมาณความน่าจะเป็นเพื่อการอยู่รอดใน R


14

จากตัวอย่างของเวลาการอยู่รอดฉันต้องการประเมินความน่าจะเป็นของเวลาที่มีชีวิตรอดสำหรับบางเฉพาะโดยใช้เครื่องมือประเมิน Kaplan-Meier เป็นไปได้ไหมที่จะทำเช่นนี้? โปรดทราบว่าไม่จำเป็นต้องเป็นเวลาของเหตุการณ์nเสื้อเสื้อRเสื้อ


1
แน่นอน: ดูฟังก์ชันการรอดชีวิต () ของแพคเกจการเอาชีวิตรอด [ประเภทความช่วยเหลือ (แพ็คเกจ = "การอยู่รอด")]
Stéphane Laurent

3
@Stephane Laurent: ฟังก์ชั่น surfit () จะเอาท์พุตการเอาตัวรอดโดยประมาณในเวลาเหตุการณ์ แต่ฉันต้องการมีขั้นตอนอัตโนมัติในการคำนวณการเอาตัวรอดนั้นได้ตลอดเวลา t ขอบคุณ ...
user7064

จากนั้นใช้ประมาณ ()
Stéphane Laurent

ฉันขอตัวอย่างได้ไหม
user7064

คำตอบ:


23

คุณสามารถใช้การส่งออกของsurvfitฟังก์ชั่นจากแพคเกจและให้ที่survivalstepfun

km <- survfit(Surv(time, status)~1, data=veteran)
survest <- stepfun(km$time, c(1, km$surv))

ขณะนี้survestเป็นฟังก์ชันที่สามารถประเมินได้ตลอดเวลา

> survest(0:100)
  [1] 1.0000000 0.9854015 0.9781022 0.9708029 0.9635036 0.9635036 0.9635036
  [8] 0.9416058 0.9124088 0.9124088 0.8978102 0.8905109 0.8759124 0.8613139
 [15] 0.8613139 0.8467153 0.8394161 0.8394161 0.8175182 0.8029197 0.7883212
 [22] 0.7737226 0.7664234 0.7664234 0.7518248 0.7299270 0.7299270 0.7225540
 [29] 0.7225540 0.7151810 0.7004350 0.6856890 0.6856890 0.6783160 0.6783160
 [36] 0.6709430 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700 0.6635700
 [43] 0.6561970 0.6488240 0.6414510 0.6340780 0.6340780 0.6340780 0.6267050
 [50] 0.6193320 0.6193320 0.5972130 0.5750940 0.5677210 0.5529750 0.5529750
 [57] 0.5456020 0.5456020 0.5456020 0.5382290 0.5382290 0.5308560 0.5308560
 [64] 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830 0.5234830
 [71] 0.5234830 0.5234830 0.5161100 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.5087370
 [78] 0.5087370 0.5087370 0.5087370 0.4939910 0.4939910 0.4866180 0.4866180
 [85] 0.4791316 0.4791316 0.4791316 0.4716451 0.4716451 0.4716451 0.4640380
 [92] 0.4640380 0.4564308 0.4564308 0.4564308 0.4412164 0.4412164 0.4412164
 [99] 0.4412164 0.4257351 0.4179945

เซอร์เรียลกำลังมีปัญหากำลังมองหาคำตอบใน StackExchange ค้นหาคำถามเดียวกันและตระหนักว่าคุณเป็นคนที่ตอบเกือบ 7 ปีที่ผ่านมา ...
Brian Diggs

7

พารามิเตอร์เวลาสามารถส่งผ่านไปยังฟังก์ชันสรุปของวัตถุ survfit:

summary(km, times=100)

เวกเตอร์สามารถส่งผ่าน:

summary(km, times=0:100)
โดยการใช้ไซต์ของเรา หมายความว่าคุณได้อ่านและทำความเข้าใจนโยบายคุกกี้และนโยบายความเป็นส่วนตัวของเราแล้ว
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.