การทดสอบทางสถิติใดที่ควรใช้เพื่อทดสอบการเพิ่มประสิทธิภาพของรายการยีน

ฉันได้ทำการทดลองเพื่อทดสอบความไวของเซลล์ต่อตัวแทนทำลาย DNA ที่แน่นอน เราพบว่ามี 270 ยีนที่ไวต่อยาโดยเฉพาะและจำนวนยีนที่วิเคราะห์ได้ทั้งหมดคือ 3668. 38 จาก 270 ยีนที่ละเอียดอ่อนจัดอยู่ในประเภท "ยีนซ่อมแซมดีเอ็นเอ" หากจำนวนของ "ยีนซ่อมแซมดีเอ็นเอ" ที่มีอยู่ในจีโนมคือ 112 และจำนวนทั้งหมดของยีนในจีโนมคือ 3668 ยีนที่มีความละเอียดอ่อนเพิ่มคุณค่าในยีนซ่อมแซมดีเอ็นเอหรือไม่ ควรใช้การทดสอบทางสถิติใด ฉันจะขอบคุณถ้าคุณสามารถบอกเครื่องมือในการคำนวณค่า p ออนไลน์ได้

การปฏิบัติตามมาตรฐานการทดสอบสำหรับการเพิ่มคุณค่าของรายการยีนคือการทำแบบทดสอบ hypergeometric หรือเท่ากันหนึ่งด้านการทดสอบที่แน่นอนฟิชเชอร์ คุณมีตารางฉุกเฉินดังต่อไปนี้:$2\times2$

คุณสามารถทำการทดสอบได้Rดังนี้:

fisher.test(matrix(c(38,74,232,3324),nrow=2,ncol=2),alternative="greater")

ซึ่งให้ผลลัพธ์ที่สำคัญอย่างมาก:

Fisher's Exact Test for Count Data

data:  matrix(c(38, 74, 232, 3324), nrow = 2, ncol = 2) 
p-value < 2.2e-16
alternative hypothesis: true odds ratio is greater than 1 
95 percent confidence interval:
5.062107      Inf 
sample estimates:
odds ratio 
7.34918

โปรดทราบว่าในขณะที่เรามีการทดสอบมานานกว่าตัวแทน (แทนที่จะอยู่ภายใต้การเป็นตัวแทน) เดอะพารามิเตอร์ถูกตั้งค่าให้alternative"greater"