การทดสอบเพื่อเปรียบเทียบองค์ประกอบชุมชนคืออะไร

หวังว่าคำถาม newbie นี้เป็นคำถามที่เหมาะสมสำหรับเว็บไซต์นี้:

สมมติว่าฉันต้องการเปรียบเทียบองค์ประกอบของชุมชนนิเวศวิทยาที่สองไซต์ A, B. ฉันรู้ว่าทั้งสามไซต์มีสุนัขแมววัวและนกดังนั้นฉันจึงลองชิมความอุดมสมบูรณ์ของพวกเขาในแต่ละไซต์ (ฉันไม่มี " คาดว่า "ความอุดมสมบูรณ์ของสัตว์แต่ละตัวในแต่ละไซต์)

ถ้าฉันนับให้พูดว่าสัตว์แต่ละตัวห้าตัวในแต่ละไซต์ A และ B นั้น "คล้ายกัน" มาก

แต่ถ้าฉันเจอสุนัข 100 ตัวแมว 5 ตัววัว 2 ตัวและนก 3 ตัวที่ไซต์ A. สุนัข 5 ตัวแมว 3 ตัววัว 75 ตัวและนก 2 ตัวที่ไซต์ B จากนั้นฉันจะบอกว่าไซต์ A และ B นั้นแตกต่างกัน แม้ว่าจะมีองค์ประกอบสปีชีส์เดียวกันแน่นอน

(ฉันอ่านดัชนีโซเรนเซนและเบรย์ - เคอร์ติส แต่ดูเหมือนว่าพวกเขาจะพิจารณาว่ามี / ไม่มีสุนัขแมว ฯลฯ และไม่มีความอุดมสมบูรณ์)

มีการทดสอบทางสถิติเพื่อตรวจสอบสิ่งนี้หรือไม่?

ฉันจะเห็นพ้องกับสิ่งที่ถูกกล่าวถึงว่าเบรย์ - เคอร์ติสสามารถจัดการกับความอุดมสมบูรณ์รวมถึงการมีอยู่ / ไม่ได้รวมไปถึงการเพิ่มหนังสือดีอีกเล่มลงในส่วนผสม: การวิเคราะห์ชุมชนเชิงนิเวศวิทยาโดย McCune และเกรซ

มีหลายปัจจัยที่ต้องพิจารณาเมื่อคุณเปรียบเทียบชุมชนทางนิเวศวิทยาและฉันไม่คิดว่าจะมีการทดสอบเดียวที่จะทำงาน ความเหมาะสมของการทดสอบนั้นขึ้นอยู่กับประเภทของคำถามที่คุณถามเกี่ยวกับชุมชนและธรรมชาติของชุดข้อมูลของคุณ วิธีการทั่วไปรวมถึงเทคนิคการบวชซึ่งไซต์อาร์เรย์ภายในแท็กซอนหลายมิติ อย่างไรก็ตามหากคุณมีเว็บไซต์เพียง 2 แห่งเท่านั้นนี่ไม่น่าจะเป็นไปได้ การทดสอบ Mantel มีความสัมพันธ์กับเมทริกซ์ระยะทางตามองค์ประกอบ (เช่นระยะทางเบรย์เคอร์ติสแบบคู่ในทุกพื้นที่) กับเมทริกซ์ระยะทางตามปัจจัยที่มีอิทธิพลอื่น ๆ กรณีที่ง่ายที่สุดอาจเป็นเพียงระยะทางยูคลิดระหว่างไซต์ในอวกาศ การวิเคราะห์กลุ่มเว็บไซต์กลุ่มที่เกี่ยวข้องกับองค์ประกอบชุมชนของพวกเขา

โดยทั่วไปฉันจะใช้วิธีการใช้ชุดย่อยของเครื่องมือทางสถิติมากมายที่อธิบายไว้ในหนังสือข้างต้นเพื่อให้คำอธิบายทางสถิติของความแตกต่างระหว่างชุมชนที่มีปัญหา ไม่มีการวัดความแตกต่างเพียงอย่างเดียวในการจัดองค์ประกอบชุมชนเพื่อใช้สถิติในการสังเคราะห์ข้อมูลหลายมิติในรูปแบบที่ตีความได้ง่ายขึ้น

แก้ไข: ฉันแค่คิดถึงบทความนี้ซึ่งวางตัวเลือกต่าง ๆ มากมายอย่างชัดเจนและทั่วถึง

แอนเดอร์สัน, MJ และคณะ 2011. การนำทางความหมายหลายประการของความหลากหลายเบต้า: แผนงานสำหรับนักนิเวศวิทยาการฝึก ตัวอักษรนิเวศวิทยา 14: 19-28

หากคุณต้องการทดสอบ hyothesis นี้คุณสามารถใช้การวิเคราะห์ความคล้ายคลึงกัน (ขึ้นอยู่กับ Bray Curtis หรืออื่น ๆ ที่มี) มีขั้นตอนที่ชื่อว่า ANOSIM ซึ่งใช้งานในซอฟต์แวร์ PRIMER คุณสามารถทำการวิเคราะห์ทางเดียวแบบซ้อนหรือแบบสองทาง ตัวเลือกอื่น (ดีกว่า) คือการวิเคราะห์ความแปรปรวนแบบหลายขั้นตอนวิธีที่ดีนั้นมีให้ใน PERMANOVA ประจำ (มีให้ที่http://www.stat.auckland.ac.nz/~mja/Programs.htm ) เมื่อคุณ มีการทดสอบความแตกต่าง signficant ระหว่างไซต์คุณสามารถติดตามเพื่อทราบว่าสปีชีส์ใดที่รับผิดชอบต่อความแตกต่างที่สังเกตได้ (รูทีน IndVal หรือรูทีน SIMPER) หวังว่ามันจะช่วย

เนื่องจากคุณพูดถึงดัชนีโซเรนเซนดูเหมือนว่าคุณต้องการคะแนนที่แตกต่างกันมากกว่าการทดสอบที่แตกต่างกัน (คะแนนจะให้ค่าตัวเลขที่ระบุว่าแตกต่างกันอย่างไรการทดสอบจะบอกคุณว่าความแตกต่างนั้นมีความสำคัญกับความน่าจะเป็นหรือไม่)

คุณสามารถแสดงความอุดมสมบูรณ์ของสปีชีส์ในแต่ละตำแหน่งด้วยฮิสโตแกรม ฮิสโตแกรมนี้สามารถทำให้เป็นมาตรฐานได้หากคุณสนใจเรื่องความอุดมสมบูรณ์ของญาติ (เช่นแมวนั้นมีจำนวนสุนัขมากเป็นสองเท่า) หรือไม่ผิดปกติหากคุณสนใจตัวเลขที่แน่นอนเช่นกัน

มีหลายวิธีในการวัดความแตกต่างของฮิสโตแกรม สิ่งที่ได้รับความนิยม ได้แก่ :

• สถิติไคสแควร์
• ระยะทาง L2
• ระยะทางแยกฮิสโทแกรม

Bray-Curtis และดัชนีอื่น ๆ ที่คล้ายคลึงกันนั้นมีความแตกต่างในความอุดมสมบูรณ์ของสายพันธุ์ นอกจาก Legendre และ Legendre ฉันจะแนะนำหนังสือของ Charles Krebs, Ecological Methology (1999)