เรียกใช้คำสั่งบนหลาย ๆ ไฟล์และบันทึกผลลัพธ์สำหรับแต่ละไฟล์ในไฟล์ที่แตกต่างกันอย่างไร [ปิด]

ฉันมี vcf-file (file.vcf) และไฟล์ประชากรหลายไฟล์(HA1.txt, HA1.txt, HA2.txt,...,HA28.txt)ที่มี ID แต่ละรายการ

ไฟล์ประชากรแต่ละไฟล์มีลักษณะดังนี้ (แต่ละบรรทัดเป็นหนึ่งไฟล์):

$ cat HA1.txt
    QQ48_SD1A-37    
    ED19_SD1A40-3_357
    TT335_SD1A-20
    HH356_SD1A-7
    Q029B_SD1A38    
    HT73_SD1A-28    
    HT288_SD1A-24
    Q004B_SD1A-1    
    Q027_SD1A-4
    Q096_SD1A-40

ฉันต้องการแยกความลึกของการครอบคลุมสำหรับแต่ละบุคคลในแต่ละประชากร ฉันจะรันคำสั่งนี้ได้อย่างไร: grep -v "^#" file.vcf | cut -f 10 | cut -d ':' -f2สำหรับแต่ละคนในไฟล์ประชากรและบันทึกผลลัพธ์ของประชากรแต่ละคนในไฟล์แยกกัน

ผลลัพธ์ที่ฉันต้องการสำหรับประชากรแต่ละคนมีลักษณะดังนี้:

.   6   4   6   .   5   .   10  .   7   .
.   9   16  8   3   8   .   16  9   22  .
.   8   11  8   .   8   .   16  8   18  .
6   20  12  20  12  28  3   24  4   26  14
6   25  15  24  13  32  3   25  3   25  15

แต่ละคอลัมน์ในหนึ่งบุคคล!

for file in *; do grep '[pattern]' "$file" | cut -f 10 | cut -d ':' -f2 > "$file.output"; done