มีเอกสารจำนวนมากและการอภิปรายเกี่ยวกับเรื่องนี้ในเน็ต
คำตอบสั้น ๆ ว่ามีความแตกต่างทางอุดมการณ์ลึกระหว่างโครงการ GNU และโครงการเคอร์เนล Linux ซึ่งได้รับการรวมกันเป็นไปได้
การมุ่งเน้นของ FSF ซึ่งเป็นองค์กรที่อยู่เบื้องหลังโครงการ GNU นั้นเกี่ยวกับความบริสุทธิ์ทางอุดมการณ์ที่เกี่ยวข้องกับแนวคิดของซอฟต์แวร์เสรี สิ่งนี้นำมาจากมุมมองของ Richard Stallman ผู้ก่อตั้ง FSF / GNU นอกจากนี้ดังที่ goldilocks ได้กล่าวไว้ FSF จึงเป็นองค์กรสนับสนุนทางการเมืองเป็นส่วนใหญ่ เป็นเวลานานแล้วที่ FSF ไม่ได้ใส่ทรัพยากรที่สำคัญลงในโครงการ GNU แม้ว่าพวกเขาจะให้โครงสร้างพื้นฐานการสนับสนุน
โครงการเคอร์เนลลีนุกซ์มีจุดยืนเชิงปฏิบัติที่มากขึ้นเกี่ยวกับเสรีภาพด้านซอฟต์แวร์อีกครั้งในระดับใหญ่ที่เกิดจากผู้ก่อตั้ง Linus Torvalds โครงการเคอร์เนลลีนุกซ์เป็นโครงการซอฟต์แวร์ฟรีซึ่งประกอบด้วยนักพัฒนาซอฟต์แวร์ที่เชี่ยวชาญในการพัฒนาเคอร์เนล / ระบบปฏิบัติการและไม่เคารพองค์กรสนับสนุนทางการเมือง
ในฐานะตัวอย่างเฉพาะของวิธีการที่อุดมการณ์เหล่านี้มีบทบาทในทางปฏิบัติให้พิจารณา
1) Stallman พิจารณาแล้วว่ายอมรับไม่ได้กับความจริงที่ว่าโครงการ Debian "โฆษณา" ซอฟต์แวร์ที่ไม่ปลอดโดยรักษาส่วนที่ไม่ปลอดของซอฟต์แวร์เก็บถาวร นี่เป็นเรื่องน่าขันเนื่องจากโครงการ Debian ให้ความสำคัญกับความเป็นอิสระของซอฟต์แวร์ที่ค่อนข้างคล้ายกับ FSF ในขณะที่ไม่เข้มงวดในเชิงอุดมคติ
2) ลีนุกซ์เคอร์เนลอนุญาตให้ใช้เคอร์เนลไบนารี่ (ไม่ใช้) กับเคอร์เนลได้ ในขณะที่นักพัฒนาเคอร์เนลไม่กระตือรือร้นเกี่ยวกับเรื่องนี้พวกเขาก็ทน แต่มันก็ยากที่จะจินตนาการว่า FSF ทำเช่นนั้น
นอกจากนี้ยังเป็นที่น่าสังเกตว่าความพยายามของ Stallman ในการตั้งชื่อระบบปฏิบัติการโดยใช้เคอร์เนล Linux เนื่องจาก GNU / Linux อาจไม่ได้ปรับปรุงความสัมพันธ์ระหว่าง FSF และชุมชนเคอร์เนล Linux แม้ว่าฉันจะไม่มีข้อมูลเฉพาะเกี่ยวกับเรื่องนี้
นอกเหนือจากสิ่งอื่นใดแล้วเช่นเดียวกับ goldilocks ที่กล่าวถึง FSF มีกฎหลายอย่างที่โครงการ GNU ต้องปฏิบัติตาม ซึ่งรวมถึงการมอบหมายลิขสิทธิ์ของรหัสทั้งหมดให้กับ FSF ทั้งหมดนี้จะเป็นตัวแบ่งข้อตกลงเนื่องจาก Linus Torvalds ไม่เคยต้องการการมอบหมายลิขสิทธิ์ดังกล่าว ดังนั้นหากเคอร์เนลลินุกซ์เป็นส่วนหนึ่งของโครงการ GNU การมีส่วนร่วมที่สำคัญทั้งหมดในเคอร์เนลลินุกซ์จะต้องมีการมอบหมายลิขสิทธิ์ของพวกเขาให้กับ FSF เมื่อพิจารณาถึงอายุและขนาดของโครงการและจำนวนผู้มีส่วนร่วมจึงเป็นไปไม่ได้ โครงการขนาดเล็กและอายุน้อยกว่านั้น (เช่น Mercurial) ได้พบว่าการมอบซอฟต์แวร์เป็นงานที่น่ากังวล
โปรดทราบว่าคำตอบนี้ไม่ได้มีวัตถุประสงค์เพื่อเป็นการวิจารณ์ของ FSF หรือผู้พัฒนาเคอร์เนล Linux ทั้งสองฝ่ายมีมุมมองที่ถูกต้อง อย่างไรก็ตามความเป็นจริงของสถานการณ์คือว่าพวกเขาจะมีมุมมองที่เข้ากันไม่ได้ในระดับหนึ่ง