อ่านรูปแบบ grep จากไฟล์

ฉันมีไฟล์ข้อความขนาดใหญ่สองสามไฟล์และในไฟล์UNIQS.txtฉันมีรายการสตริงgrepจากไฟล์อื่น รหัสที่ฉันใช้คือ

grep -f UNIQS.txt EEP_VSL.uniqs.sam > UNIQ_templates.sam

ซึ่งไม่ทำอะไรเลย - ไฟล์ที่สร้างนั้นว่างเปล่า แต่เมื่อฉันทำ

grep -F -f UNIQS.txt EEP_VSL.uniqs.sam > UNIQ_templates.sam

มันทำงานได้อย่างถูกต้อง สิ่งนี้ทำให้ฉันสับสนเพราะฉันไม่คิดว่าgrepจะตีความรายการในUNIQS.txtรูปแบบ regexp โดยไม่ต้องมีเครื่องหมายคำพูดและเครื่องหมายทับและอยู่ในไฟล์ (ซึ่งไม่มี) โดยทั่วไปแล้วถ้าคุณได้รับรูปแบบจากไฟล์มันจะคิดว่ามันเป็นรูปแบบ regexp โดยอัตโนมัติหรือไม่?

แก้ไข:ในUNIQS.txtไฟล์มีสตริงที่คั่นด้วยบรรทัดใหม่ของฟอร์ม

HWI-ST365:215:D0GH0ACXX:2:1101:10034:186783

(เรียกว่าชื่อเทมเพลต) และEEP_VSL...แท็บไฟล์คั่นคอลัมน์ด้วยประมาณ 14 คอลัมน์และคอลัมน์แรกคือชื่อเทมเพลตดังนั้นโดยทั่วไปฉันต้องการแยกบรรทัดที่สอดคล้องกับเทมเพลตแต่ละไฟล์

-fตัวเลือกระบุแฟ้มที่ grep อ่านรูปแบบ นั่นเหมือนกับการส่งรูปแบบบนบรรทัดคำสั่ง (พร้อม-eตัวเลือกหากมีมากกว่าหนึ่ง) ยกเว้นว่าเมื่อคุณโทรจากเชลล์คุณอาจจำเป็นต้องอ้างอิงรูปแบบเพื่อป้องกันอักขระพิเศษจากการขยายโดยเชลล์

มีข้อโต้แย้ง-Eหรือ-Fหรือ-Pถ้ามีบอก grep ซึ่งไวยากรณ์รูปแบบที่เขียนด้วยอาร์กิวเมนต์ไม่มี grep คาดว่า. นิพจน์ปกติพื้นฐาน ; ด้วย-E, grep คาดว่าจะขยายการแสดงออกปกติ ; ด้วย-P(ถ้าสนับสนุน), grep คาดว่านิพจน์ปกติของ Perl ; และด้วย-Fgrep ต้องการสตริงตัวอักษร ไม่ว่ารูปแบบจะมาจากบรรทัดคำสั่งหรือมาจากไฟล์ไม่สำคัญ

โปรดทราบว่าสตริงนั้นเป็นสตริงย่อย: หากคุณผ่านa+bเป็นรูปแบบแล้วบรรทัดที่มีa+b+cจะถูกจับคู่ หากคุณต้องการค้นหาบรรทัดที่มีสตริงที่ระบุอย่างใดอย่างหนึ่งและไม่มีอีกต่อไปให้ผ่าน-xตัวเลือก

ฉันมีข้อผิดพลาดเดียวกันไม่แก้ไขด้วยคำตอบที่ดีจาก @gilles เมื่อมองเข้าไปใกล้ไฟล์อินพุตฉันพบว่ามีการขึ้นบรรทัดใหม่ 2 บรรทัดในตอนท้าย หากไม่มีสิ่งเหล่านี้สำเร็จจำเป็นเท่านั้น: ไฟล์ grep -i file_pattern_input

(GNU grep 3.1, ไฟล์อินพุตมากกว่า 5,000 เรคคอร์ด, การจับคู่ / รูปแบบไฟล์ 2536 ฉันรู้ว่า 2536 ทั้งหมดจะต้องอยู่ในไฟล์ด้วยการขึ้นบรรทัดใหม่มีทุกบรรทัดของไฟล์และไม่มีเฉพาะ 2536 บรรทัดที่ตรงกัน)