การวิเคราะห์เชิงพื้นที่และการจัดกลุ่มใกล้คุณสมบัติ


11

ฉันกำลังทำงานเกี่ยวกับพฤติกรรมการทำเครื่องหมายในสัตว์มีชีวิตกลุ่มและฉันสนใจว่าพฤติกรรมการทำเครื่องหมายได้รับผลกระทบจากลักษณะบางอย่างของกลุ่มเพื่อนบ้านอย่างไร ฉันได้วางแผนอาณาเขตของแต่ละกลุ่มจากกลุ่มคนที่มีความหนาแน่น 95% ที่สร้างขึ้นโดยใช้ a-LoCoH เครื่องหมายของแต่ละบุคคลจากกลุ่มถูกพล็อตเป็นเลเยอร์จุดแยก พฤติกรรมการทำเครื่องหมายไม่ปรากฏว่ามีการสุ่มและดูเหมือนว่าจะจัดกลุ่มรอบ ๆ ขอบเขตกับกลุ่มเพื่อนบ้าน ฉันต้องการตรวจสอบว่าบุคคลทำเครื่องหมายใกล้กลุ่มมากกว่ากลุ่มใกล้เคียงหรือไม่ตัวอย่างเช่นบุคคลทำเครื่องหมายกลุ่มใกล้น้อยกว่าที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดหรือไม่ เป็นไปได้หรือไม่ที่จะแสดงให้เห็นว่ามีการจัดกลุ่มคะแนนไว้ใกล้กับคุณลักษณะบางอย่าง แต่ไม่ใกล้กับสถานที่อื่น ๆ ?

ความช่วยเหลือใด ๆ ที่สามารถให้ได้จะได้รับการชื่นชมอย่างมาก

เดฟฮัมฟรีส์

##### อัปเดต

สำหรับการสาธิตด้านล่างเป็นภาพของสี่พื้นที่ (A, B, C และ D) และตำแหน่งการทำเครื่องหมายของบุคคลสองคนจากกลุ่ม A กลุ่ม A และ B มีความสัมพันธ์กันอย่างใกล้ชิด กลุ่ม C และ D ไม่เกี่ยวข้องกับกลุ่ม A

ป้อนคำอธิบายรูปภาพที่นี่


1
คุณสามารถจัดหาข้อมูลตัวอย่างได้หรือไม่
om_henners

ขออภัยฉันยังใหม่กับการแลกเปลี่ยนสแต็ค - และ GIS สำหรับเรื่องนั้นรูปแบบมาตรฐานในการจัดหาข้อมูลตัวอย่างคืออะไร เอกสาร ArcMap?
เดฟฮัมฟรีส์

1
ข้อมูลตัวอย่างควรเผยแพร่ในรูปแบบ GIS แบบเปิดที่อ่านได้โดยระบบ GIS จำนวนมาก
markus

ไฟล์ที่เกี่ยวข้องบางส่วนเป็นไฟล์รูปร่างและเนื่องจากฉันเข้าใจว่าไม่มีวิธีการแชร์ไฟล์ประเภทนี้ใน SE ในขณะนี้ ฉันยินดีที่จะให้ตัวอย่างผ่านทางอีเมล์ได้ที่: david.humphries@mq.edu.au
Dave Humphries

คำถามอื่นในขณะที่ฉันกำลังคิดเกี่ยวกับเรื่องนี้ (กลับหยุดวันหยุด) - ขอบเขต a-LoCoH ผลิตจากชุดข้อมูลการทำเครื่องหมายเดียวกันหรือชุดข้อมูลที่แตกต่างกันหรือไม่ นอกจากนี้คุณใช้ซอฟต์แวร์ประเภทใด (และคุณมีสิทธิ์เข้าถึง)
om_henners

คำตอบ:


1

ฉันขอแนะนำอย่างยิ่งให้ดูที่Rโดยเฉพาะแพ็คเกจ spatstat จาก CSRIO มีคู่มือ / การสอนที่ยอดเยี่ยมโดยศาสตราจารย์ Adrian Baddeleyซึ่งจะนำคุณผ่านวิธีการต่าง ๆ สำหรับการวิเคราะห์รูปแบบจุด บางส่วนฉันจะดูที่ส่วนที่ 7: รูปแบบการทำเครื่องหมายจุด (โดยเฉพาะฟังก์ชั่นความสัมพันธ์ของมาร์คในหน้า 202) เครื่องหมายหมายเหตุที่นี่อ้างถึงข้อมูลที่ถูกจัดประเภทโดยแอททริบิวแทนการมีความสัมพันธ์เป็นตัวเลข

นอกจากนี้ยังมีบทเกี่ยวกับการอ่านข้อมูลใน (โดยใช้rgdal , spฯลฯ ) ที่จุดเริ่มต้นของเอกสาร หากคุณใช้ ArcGIS ฉันจะดูGeospatial Modeling Environmentเป็นวิธีหนึ่งในการเชื่อมโยงข้อมูลระหว่าง R และ ArcGIS มิฉะนั้น QGIS จะจัดการ Rซึ่งจะทำเช่นเดียวกัน

สุดท้าย @whuber (ท่ามกลางคนอื่น ๆ ) ที่นี่ใน GIS SE มีจำนวนมากประสบการณ์ใน R ดังนั้นถามคำถามที่คุณพบพวกเขาหรือลองและคว้าเขาในการแชท


ขอบคุณมากสำหรับคำแนะนำของคุณ ฉันจะลองแพ็คเกจ spatstat และดูว่าฉันจะไปอย่างไร
เดฟฮัมฟรีส์
โดยการใช้ไซต์ของเรา หมายความว่าคุณได้อ่านและทำความเข้าใจนโยบายคุกกี้และนโยบายความเป็นส่วนตัวของเราแล้ว
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.