สาเหตุของข้อผิดพลาด "หมายเลขวิเศษไม่ถูกต้อง" เมื่อโหลดพื้นที่ทำงานและจะหลีกเลี่ยงได้อย่างไร

ฉันพยายามโหลดพื้นที่ทำงาน R ของฉันและได้รับข้อผิดพลาดนี้:

Error: bad restore file magic number (file may be corrupted) -- no data loaded
In addition: Warning message:
file ‘WORKSPACE_Wedding_Weekend_September’ has magic number '#gets'
   Use of save versions prior to 2 is deprecated 

ฉันไม่ได้สนใจรายละเอียดทางเทคนิคเป็นพิเศษ แต่ส่วนใหญ่เป็นสาเหตุของมันและฉันจะป้องกันได้อย่างไรในอนาคต นี่คือข้อสังเกตบางประการเกี่ยวกับสถานการณ์:

1. ฉันใช้ R 2.15.1 บน MacBook Pro ที่ใช้ Windows XP บนพาร์ติชัน bootcamp
2. มีบางอย่างผิดปกติอย่างเห็นได้ชัดว่าไฟล์พื้นที่ทำงานนี้มีน้ำหนักเพียง ~ 80kb ในขณะที่ไฟล์อื่น ๆ ทั้งหมดของฉันมักจะ> 10,000
3. ในช่วงสุดสัปดาห์ฉันใช้โปรแกรมสร้างแบบจำลองภายนอกใน R และจัดเก็บเอาต์พุตไปยังวัตถุต่างๆ ฉันใช้การทำซ้ำหลายครั้งของโมเดลในช่วงหลายวันเช่น output_Saturday <- call_model ()
4. ไม่มีอะไรพิเศษสำหรับเอาต์พุตของโมเดลเป็นเพียงรายการที่มีสล็อตสำหรับ betas, VC-matrices, ข้อมูลจำเพาะของโมเดล ฯลฯ

ฉันได้รับข้อผิดพลาดนั้นเมื่อฉันใช้load()แทนsource()หรือreadRDS()โดยไม่ได้ตั้งใจ

นอกจากนี้ควรสังเกตสิ่งต่อไปนี้จากเอกสารโดยทีม R Core สรุปการเปลี่ยนแปลงในเวอร์ชันของ R หลังจาก v3.5.0 ( ที่นี่ ):

R มีรูปแบบการทำให้เป็นอนุกรมใหม่ (เวอร์ชัน 3) ซึ่งสนับสนุนการทำให้เป็นอนุกรมแบบกำหนดเองของออบเจ็กต์เฟรมเวิร์ก ALTREP ... ข้อมูลต่อเนื่องในรูปแบบ 3 ไม่สามารถอ่านได้โดยเวอร์ชันของ R ก่อนเวอร์ชัน 3.5.0

ฉันพบปัญหานี้เมื่อฉันบันทึกพื้นที่ทำงานใน v3.6.0 จากนั้นแชร์ไฟล์กับเพื่อนร่วมงานที่ใช้ v3.4.2 ฉันสามารถแก้ไขปัญหาได้โดยเพิ่ม "version = 2" ในฟังก์ชันบันทึกของฉัน

สมมติว่าไฟล์ของคุณชื่อ "myfile.ext"

หากไฟล์ที่คุณพยายามโหลดไม่ใช่ R-script ซึ่งคุณจะใช้

source("myfile.ext")

คุณอาจลองใช้readRDSฟังก์ชันและกำหนดให้เป็นชื่อตัวแปร:

my.data <- readRDS("myfile.ext")

เลขวิเศษมาจากระบบประเภท UNIX ที่ไฟล์สองสามไบต์แรกมีเครื่องหมายระบุประเภทไฟล์

ข้อผิดพลาดนี้บ่งชี้ว่าคุณกำลังพยายามโหลดประเภทไฟล์ที่ไม่ถูกต้องลงใน R ด้วยเหตุผลบางประการ R ไม่รู้จักไฟล์นี้เป็นไฟล์เวิร์กสเปซ R อีกต่อไป

ติดตั้งแพคเกจการใช้งานแล้วreadrlibrary(readr)

นอกจากนี้ยังเกิดขึ้นเมื่อคุณพยายามที่จะload()ใช้วัตถุ rds แทนการใช้

object <- readRDS("object.rds")

ฉันได้รับข้อผิดพลาดเมื่อสร้างแพ็คเกจ R (โดยใช้ roxygen2)

สาเหตุในกรณีของฉันคือการที่ฉันได้บันทึกไว้data/mydata.RDataมีมากกว่าsaveRDS() save()เช่นsave(iris, file="data/iris.RData")

สิ่งนี้ช่วยแก้ปัญหาให้ฉันได้ ฉันพบข้อมูลนี้ที่นี่

นอกจากนี้โปรดทราบว่าด้วยsave()/ load()อ็อบเจ็กต์ถูกโหลดด้วยชื่อเดียวกับที่บันทึกไว้ในตอนแรก (กล่าวคือคุณไม่สามารถเปลี่ยนชื่อได้จนกว่าจะโหลดลงในสภาพแวดล้อม R ภายใต้ชื่อที่มีเมื่อคุณบันทึกครั้งแรก)

ฉันมีปัญหานี้เมื่อฉันบันทึกไฟล์ Rdata ใน R เวอร์ชันเก่าแล้วฉันพยายามเปิดไฟล์ใหม่ ฉันแก้ไขโดยการอัปเดตเวอร์ชัน R ของฉันเป็นเวอร์ชันใหม่ล่าสุด

หากคุณกำลังทำงานด้วยdevtoolsให้พยายามบันทึกไฟล์ด้วย:

devtools::use_data(x, internal = TRUE)

จากนั้นลบไฟล์ทั้งหมดที่บันทึกไว้ก่อนหน้านี้

จาก doc:

ภายในถ้าเป็นเท็จบันทึกแต่ละออบเจ็กต์ในไฟล์. rda แต่ละไฟล์ในไดเร็กทอรีข้อมูล สิ่งเหล่านี้พร้อมใช้งานทุกครั้งที่โหลดแพ็กเกจ ถ้าเป็น TRUE เก็บอ็อบเจ็กต์ทั้งหมดไว้ในไฟล์ R / sysdata.rda ไฟล์เดียว วัตถุเหล่านี้มีอยู่ในแพ็คเกจเท่านั้น