ข้อผิดพลาด pydot และ graphviz: ไม่สามารถนำเข้า dot_parser การโหลดไฟล์ dot จะไม่สามารถทำได้

เมื่อฉันรันโค้ดง่ายๆด้วย pydot

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

มันพิมพ์ข้อความแสดงข้อผิดพลาด:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

ฉันใช้ python 2.7.3

คำตอบสำหรับpydot >= 1.1:

ความเข้ากันไม่ได้ของ (ต้นน้ำ) pydotได้รับการแก้ไขโดย6dff94b3f1และpydot >= 1.1จะเข้ากันได้กับpyparsing >= 1.5.7 .

คำตอบใช้ได้กับpydot <= 1.0.28:

สำหรับใครก็ตามที่เจอปัญหานี้มันเกิดจากการเปลี่ยนแปลงในการแยกประเภทจาก 1.x เป็น 2.x ในการติดตั้ง pydot โดยใช้ pip ให้ติดตั้ง pyparsing เวอร์ชันเก่าก่อน:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

หากคุณไม่ได้ติดตั้งpyparsingโดยใช้pipแต่ใช้แทนsetup.pyให้ดูวิธีแก้ปัญหานี้เพื่อถอนการติดตั้งแพ็คเกจ ขอบคุณ @qtips

มีแพ็คเกจใหม่ใน pip repo ที่เรียกว่า pydot2 ซึ่งทำงานได้อย่างถูกต้องกับ pyparsing2 ฉันไม่สามารถดาวน์เกรดแพ็กเกจได้เนื่องจาก matplotlib ขึ้นอยู่กับแพ็กเกจ pyparsing ที่ใหม่กว่า

หมายเหตุ: python2.7 จาก macports

pydot ใช้ตัวแปรโมดูลส่วนตัว (_noncomma) จาก pyparsing ความแตกต่างด้านล่างแก้ไขเพื่อใช้สำหรับ pyparsing 2.0.1:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

ฉันแยกที่เก็บ pydot [1] ใช้แพตช์ Gabi Davar และการเปลี่ยนแปลงบางอย่างเพื่อรองรับ python-3 แพคเกจนี้มีอยู่ใน PyPI [2]

ไชโย

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

ดูลิงค์ต่อไปนี้: http://infidea.net/troubleshooting-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

วิธีแก้ปัญหาไม่ใช่การติดตั้ง pydot จากที่ไหนสักแห่ง แต่เป็น "python-pydot" จากที่เก็บ Ubuntu อย่างเป็นทางการ

ตอนนี้มีอีกอย่างน้อย 2 เวอร์ชันที่รองรับ PyParsing-2 และ Python-3:

• PyDotPlusโดยCarlos Jenkinsพร้อมกับ travis buildbot ที่สวยงามและเอกสารประกอบที่สวยงาม อย่างไรก็ตามคุณจะต้องเปลี่ยนชื่อโฟลเดอร์จากsite-packages\pydotplusเป็นsite-packages\pydotเป็นเพื่อให้ทำงานกับโปรแกรมที่มีอยู่ซึ่งนำเข้า pydot
• pydot3kโดยbmcorser เศร้าไม่ได้ผล!
• prologic / pydotโดย James Mills ที่เชื่อมโยงจากหน้ารหัส pydot Google อย่างเป็นทางการเป็น ...

  สาขาสำหรับความเข้ากันได้ของ Python 3

• และนี่คือลิงค์ที่ใช้งานได้กับ pydot2 ของ David Villa ซึ่งใช้งานได้ดี: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

ฉันมีปัญหาอีกครั้งและวิธีแก้ปัญหาข้างต้นไม่ได้ผล หากเป็นเช่นนั้นสำหรับคุณและคุณกำลังใช้ Anaconda บน Mac กับ El Capitan ให้ลองทำดังนี้:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

สิ่งที่ฉันทำในตอนท้ายหลังจากพยายามมากมายจากสิ่งที่ฉันเห็นที่นี่ (ลำดับหลอกเพื่อให้มันทำงานกับ networkx):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

สิ่งนี้ใช้ได้ผลสำหรับฉัน (Mac OS X 10.9 พร้อม Python 2.7.10 บน Anaconda):

conda uninstall pydot

จากนั้น

conda install pydot

จากนั้น Pyparsing จะลดระดับลง (จาก 2.x เป็น 1.5.7) เมื่อติดตั้ง pydot Googler ในอนาคต: สิ่งนี้ทำให้ฉันสามารถติดตั้งและนำเข้า Theano ได้อย่างถูกต้อง

บน OSX Mavericks ทำเคล็ดลับต่อไปนี้ ... ฉันได้รับข้อผิดพลาดเดียวกัน แต่ที่ด้านล่างยังมีข้อร้องเรียนว่าไม่มีไฟล์ปฏิบัติการของ graphviz ... ฉันคิดว่าปัญหาคือฉันได้ติดตั้ง graphviz ก่อนโมดูลอื่นหรือไม่

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

เมื่อวิธีแก้ปัญหาอื่นไม่ได้ผลนี่เป็นวิธีที่รวดเร็วและสกปรกในการแก้ปัญหา:

ตัวอย่างนี้มาจาก python 2.7 บน Ubuntu 16.04

แก้ไขไฟล์ python2.7 / site-Packages / keras / utils / visualize_util.py และแสดงความคิดเห็นในส่วนของโค้ดด้านล่าง

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz () ซ้ำซ้อนกับ pydot เวอร์ชันใหม่กว่าและการเรียกด้านบนไม่ทำงาน

ฉันยังพบปัญหาและ pydot ของฉัน == 1.0.28 ในขณะที่ pyparsing == 2.2.0 ฉันแก้ไขปัญหาโดยดาวน์โหลด pydot 1.2.3 (tar.gz) ใหม่ล่าสุดจาก google แล้วติดตั้งแบบออฟไลน์ เมื่อฉันอัปเดต pydot ใน ubuntu 14.04 มันบอกว่า pydot 1.0.28 เป็นเวอร์ชันใหม่ล่าสุด ดังนั้นฉันจึงดาวน์โหลดจาก Google เวอร์ชัน 1.2.3

คุณต้องดาวน์เกรด pyparsing จากเวอร์ชัน 2.x เป็นเวอร์ชัน 1.5.7 เพื่อให้ pydot ทำงานได้อย่างถูกต้อง

สำหรับ win-64 โดยใช้ Conda สิ่งนี้ใช้ได้กับฉัน:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

จากนั้นฉันปิด / ถอนการติดตั้งเวอร์ชัน 2.x และโหลด pyparsing ใหม่ในสคริปต์ของฉัน:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

ในการตรวจสอบว่าคุณใช้งานเวอร์ชันที่ถูกต้องหรือไม่:

print pyparsing.__version__