วิธีการนับค่า NaN ในคอลัมน์ใน pandas DataFrame


459

ฉันมีข้อมูลที่ฉันต้องการค้นหาจำนวนNaNเพื่อที่ว่าถ้ามันน้อยกว่าขีด จำกัด บางอย่างฉันจะวางคอลัมน์นี้ ฉันดูแล้ว แต่ไม่พบฟังก์ชันใด ๆ สำหรับสิ่งนี้ มีvalue_countsแต่มันจะช้าสำหรับฉันเพราะค่าส่วนใหญ่แตกต่างกันและฉันต้องการนับNaNเท่านั้น

คำตอบ:


728

คุณสามารถใช้isna()เมธอด (หรือเป็นนามแฝงisnull()ซึ่งเข้ากันได้กับนุ่นรุ่นเก่า <0.21.0) จากนั้นรวมผลรวมเพื่อนับค่า NaN สำหรับหนึ่งคอลัมน์:

In [1]: s = pd.Series([1,2,3, np.nan, np.nan])

In [4]: s.isna().sum()   # or s.isnull().sum() for older pandas versions
Out[4]: 2

สำหรับหลายคอลัมน์มันยังทำงานได้:

In [5]: df = pd.DataFrame({'a':[1,2,np.nan], 'b':[np.nan,1,np.nan]})

In [6]: df.isna().sum()
Out[6]:
a    1
b    2
dtype: int64

31
และถ้าคุณต้องการจำนวน nans ทั้งหมดที่dfคุณสามารถใช้ได้df.isnull().sum().sum()
RockJake28

2
หากต้องการรับ colsums .sum(axis=0)ซึ่งเป็นพฤติกรรมเริ่มต้น และเพื่อให้ได้ .sum(axis=1)rowsums,
smci

1
@ RockJake28 หรือdf.isnull().values.sum()
cs95

3
df['column_name'].isna().sum()ยังทำงานได้ถ้าใครสงสัย
Superdooperhero

93

คุณสามารถลบความยาวทั้งหมดออกจากการนับค่าที่ไม่ใช่นาโน:

count_nan = len(df) - df.count()

คุณควรใช้เวลากับข้อมูลของคุณ สำหรับซีรี่ส์ขนาดเล็กนั้นมีความเร็วเพิ่มขึ้น 3 เท่าเมื่อเทียบกับisnullโซลูชัน


4
แน่นอนเวลาที่ดีที่สุด มันขึ้นอยู่กับขนาดของเฟรมที่ฉันคิดว่าด้วยเฟรมที่ใหญ่กว่า (3000 แถว) การใช้isnullเร็วกว่านี้สองเท่า
joris

5
ฉันลองทั้งสองวิธีในสถานการณ์ที่ฉันนับความยาวของกลุ่มสำหรับกลุ่มขนาดใหญ่โดยขนาดกลุ่มมักจะ <4 และ joris 'df.isnull (). sum () sum () นั้นเร็วกว่าอย่างน้อย 20 เท่า นี่คือกับ 0.17.1
Nathan Lloyd

สำหรับฉันทั้งสองอยู่ภายใต้ 3ms เฉลี่ยสำหรับ 70,000 แถวที่มีน้อยมาก
Josiah Yoder

89

สมมติว่าdfเป็น DataFrame แพนด้า

จากนั้น

df.isnull().sum(axis = 0)

สิ่งนี้จะให้จำนวนของค่า NaN ในทุกคอลัมน์

หากคุณต้องการค่า NaN ในทุกแถว

df.isnull().sum(axis = 1)

46

จากคำตอบที่ได้รับการโหวตมากที่สุดเราสามารถกำหนดฟังก์ชั่นที่ทำให้เรามี dataframe เพื่อแสดงตัวอย่างค่าที่หายไปและ% ของค่าที่หายไปในแต่ละคอลัมน์:

def missing_values_table(df):
        mis_val = df.isnull().sum()
        mis_val_percent = 100 * df.isnull().sum() / len(df)
        mis_val_table = pd.concat([mis_val, mis_val_percent], axis=1)
        mis_val_table_ren_columns = mis_val_table.rename(
        columns = {0 : 'Missing Values', 1 : '% of Total Values'})
        mis_val_table_ren_columns = mis_val_table_ren_columns[
            mis_val_table_ren_columns.iloc[:,1] != 0].sort_values(
        '% of Total Values', ascending=False).round(1)
        print ("Your selected dataframe has " + str(df.shape[1]) + " columns.\n"      
            "There are " + str(mis_val_table_ren_columns.shape[0]) +
              " columns that have missing values.")
        return mis_val_table_ren_columns

36

เนื่องจาก pandas 0.14.1 ข้อเสนอแนะของฉันที่นี่เพื่อมีอาร์กิวเมนต์คำหลักในเมธอด value_counts ถูกนำไปใช้:

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({'a':[1,2,np.nan], 'b':[np.nan,1,np.nan]})
for col in df:
    print df[col].value_counts(dropna=False)

2     1
 1     1
NaN    1
dtype: int64
NaN    2
 1     1
dtype: int64

คำตอบที่ดีที่สุดจนถึงช่วยให้สามารถนับประเภทค่าอื่น ๆ ได้เช่นกัน
gaborous

19

หากการนับค่าน่านในคอลัมน์แพนด้าเป็นวิธีที่รวดเร็ว

import pandas as pd
## df1 as an example data frame 
## col1 name of column for which you want to calculate the nan values
sum(pd.isnull(df1['col1']))

2
sushmit วิธีนี้ไม่เร็วมากถ้าคุณมีคอลัมน์จำนวนหนึ่ง ในกรณีนั้นคุณจะต้องคัดลอกและวาง / พิมพ์ในแต่ละชื่อคอลัมน์จากนั้นเรียกใช้รหัสอีกครั้ง
Amos Long

17

ถ้าคุณใช้ Jupyter Notebook แล้วจะเป็นอย่างไร ....

 %%timeit
 df.isnull().any().any()

หรือ

 %timeit 
 df.isnull().values.sum()

หรือมีข้อมูลใด ๆ ของ NaN ถ้าใช่อยู่ที่ไหน

 df.isnull().any()

13

ด้านล่างจะพิมพ์คอลัมน์น่านทั้งหมดตามลำดับจากมากไปน้อย

df.isnull().sum().sort_values(ascending = False)

หรือ

ด้านล่างจะพิมพ์คอลัมน์ Nan 15 คอลัมน์แรกตามลำดับจากมากไปน้อย

df.isnull().sum().sort_values(ascending = False).head(15)

10
import numpy as np
import pandas as pd

raw_data = {'first_name': ['Jason', np.nan, 'Tina', 'Jake', 'Amy'], 
        'last_name': ['Miller', np.nan, np.nan, 'Milner', 'Cooze'], 
        'age': [22, np.nan, 23, 24, 25], 
        'sex': ['m', np.nan, 'f', 'm', 'f'], 
        'Test1_Score': [4, np.nan, 0, 0, 0],
        'Test2_Score': [25, np.nan, np.nan, 0, 0]}
results = pd.DataFrame(raw_data, columns = ['first_name', 'last_name', 'age', 'sex', 'Test1_Score', 'Test2_Score'])

results 
'''
  first_name last_name   age  sex  Test1_Score  Test2_Score
0      Jason    Miller  22.0    m          4.0         25.0
1        NaN       NaN   NaN  NaN          NaN          NaN
2       Tina       NaN  23.0    f          0.0          NaN
3       Jake    Milner  24.0    m          0.0          0.0
4        Amy     Cooze  25.0    f          0.0          0.0
'''

คุณสามารถใช้ฟังก์ชั่นต่อไปนี้ซึ่งจะให้ผลลัพธ์ใน Dataframe

  • ค่าศูนย์
  • ค่าที่ขาดหายไป
  • % ของมูลค่ารวม
  • ค่าหายไปศูนย์รวม
  • % ค่าศูนย์ที่หายไปทั้งหมด
  • ประเภทข้อมูล

เพียงแค่คัดลอกและวางฟังก์ชั่นต่อไปนี้และเรียกมันโดยส่งดาต้าดาต้าแพนด้าของคุณ

def missing_zero_values_table(df):
        zero_val = (df == 0.00).astype(int).sum(axis=0)
        mis_val = df.isnull().sum()
        mis_val_percent = 100 * df.isnull().sum() / len(df)
        mz_table = pd.concat([zero_val, mis_val, mis_val_percent], axis=1)
        mz_table = mz_table.rename(
        columns = {0 : 'Zero Values', 1 : 'Missing Values', 2 : '% of Total Values'})
        mz_table['Total Zero Missing Values'] = mz_table['Zero Values'] + mz_table['Missing Values']
        mz_table['% Total Zero Missing Values'] = 100 * mz_table['Total Zero Missing Values'] / len(df)
        mz_table['Data Type'] = df.dtypes
        mz_table = mz_table[
            mz_table.iloc[:,1] != 0].sort_values(
        '% of Total Values', ascending=False).round(1)
        print ("Your selected dataframe has " + str(df.shape[1]) + " columns and " + str(df.shape[0]) + " Rows.\n"      
            "There are " + str(mz_table.shape[0]) +
              " columns that have missing values.")
#         mz_table.to_excel('D:/sampledata/missing_and_zero_values.xlsx', freeze_panes=(1,0), index = False)
        return mz_table

missing_zero_values_table(results)

เอาท์พุต

Your selected dataframe has 6 columns and 5 Rows.
There are 6 columns that have missing values.

             Zero Values  Missing Values  % of Total Values  Total Zero Missing Values  % Total Zero Missing Values Data Type
last_name              0               2               40.0                          2                         40.0    object
Test2_Score            2               2               40.0                          4                         80.0   float64
first_name             0               1               20.0                          1                         20.0    object
age                    0               1               20.0                          1                         20.0   float64
sex                    0               1               20.0                          1                         20.0    object
Test1_Score            3               1               20.0                          4                         80.0   float64

ถ้าคุณต้องการให้มันง่าย ๆ คุณสามารถใช้ฟังก์ชันต่อไปนี้เพื่อรับค่าที่หายไปใน%

def missing(dff):
    print (round((dff.isnull().sum() * 100/ len(dff)),2).sort_values(ascending=False))


missing(results)
'''
Test2_Score    40.0
last_name      40.0
Test1_Score    20.0
sex            20.0
age            20.0
first_name     20.0
dtype: float64
'''

10

วิธีนับเลขศูนย์:

df[df == 0].count(axis=0)

หากต้องการนับ NaN:

df.isnull().sum()

หรือ

df.isna().sum()

8

คุณสามารถใช้เมธอด value_counts และพิมพ์ค่าของ np.nan

s.value_counts(dropna = False)[np.nan]

ดี! อันนี้มีประโยชน์มากที่สุดถ้าคุณต้องการนับทั้ง NaN และ non-NaNs s.value_counts(dropna = False)
icemtel



3

นี่คือรหัสสำหรับการนับNullค่าคอลัมน์อย่างชาญฉลาด:

df.isna().sum()

3

มีบทความ Dzone ที่ดีตั้งแต่เดือนกรกฎาคมปี 2017 ซึ่งมีรายละเอียดวิธีการต่าง ๆ ในการสรุปค่า NaN ตรวจสอบออกที่นี่

บทความที่ฉันอ้างถึงให้คุณค่าเพิ่มเติมโดย: (1) การแสดงวิธีการนับและแสดงการนับ NaN สำหรับทุกคอลัมน์เพื่อให้สามารถตัดสินใจได้อย่างง่ายดายว่าจะยกเลิกคอลัมน์เหล่านั้นหรือไม่และ (2) แสดงวิธีเลือกแถวเหล่านั้นใน เฉพาะที่มี NaNs เพื่อให้พวกเขาอาจจะเลือกทิ้งหรือใส่ร้าย

ต่อไปนี้เป็นตัวอย่างแบบย่อเพื่อแสดงให้เห็นถึงประโยชน์ของวิธีการ - มีเพียงไม่กี่คอลัมน์ที่อาจมีประโยชน์ไม่ชัดเจน แต่ฉันคิดว่ามันเป็นประโยชน์สำหรับกรอบข้อมูลขนาดใหญ่

import pandas as pd
import numpy as np

# example DataFrame
df = pd.DataFrame({'a':[1,2,np.nan], 'b':[np.nan,1,np.nan]})

# Check whether there are null values in columns
null_columns = df.columns[df.isnull().any()]
print(df[null_columns].isnull().sum())

# One can follow along further per the cited article

3

อีกหนึ่งตัวเลือกง่ายๆที่ยังไม่แนะนำให้นับเพียงแค่ NaN ก็คือการเพิ่มรูปร่างเพื่อส่งคืนจำนวนแถวด้วย NaN

df[df['col_name'].isnull()]['col_name'].shape

2

df.isnull (). sum () จะให้ผลรวมคอลัมน์ของค่าที่หายไป

หากคุณต้องการทราบผลรวมของค่าที่หายไปในคอลัมน์ใดคอลัมน์หนึ่งรหัสต่อไปนี้จะใช้งานได้ df.column.isnull (). sum ()


1

ตามคำตอบที่ได้รับและการปรับปรุงบางอย่างนี่เป็นแนวทางของฉัน

def PercentageMissin(Dataset):
    """this function will return the percentage of missing values in a dataset """
    if isinstance(Dataset,pd.DataFrame):
        adict={} #a dictionary conatin keys columns names and values percentage of missin value in the columns
        for col in Dataset.columns:
            adict[col]=(np.count_nonzero(Dataset[col].isnull())*100)/len(Dataset[col])
        return pd.DataFrame(adict,index=['% of missing'],columns=adict.keys())
    else:
        raise TypeError("can only be used with panda dataframe")

ฉันชอบdf.apply(lambda x: x.value_counts(dropna=False)[np.nan]/x.size*100)
K. -Michael Aye

1

ในกรณีที่คุณต้องการรับจำนวน non-NA (ไม่ใช่ไม่มี) และ NA (ไม่มี) ให้นับตามกลุ่มต่าง ๆ ที่ดึงออกโดย groupby:

gdf = df.groupby(['ColumnToGroupBy'])

def countna(x):
    return (x.isna()).sum()

gdf.agg(['count', countna, 'size'])

ส่งคืนจำนวนนับที่ไม่ใช่ NA, NA และจำนวนรายการต่อกลุ่ม


0

ใช้โซลูชันที่เสนอโดย @sushmit ในรหัสของฉัน

รูปแบบที่เป็นไปได้ของเดียวกันยังสามารถ

colNullCnt = []
for z in range(len(df1.cols)):
    colNullCnt.append([df1.cols[z], sum(pd.isnull(trainPd[df1.cols[z]]))])

ข้อดีของการนี้คือมันส่งคืนผลลัพธ์สำหรับแต่ละคอลัมน์ใน df ต่อจากนี้ไป


0
import pandas as pd
import numpy as np

# example DataFrame
df = pd.DataFrame({'a':[1,2,np.nan], 'b':[np.nan,1,np.nan]})

# count the NaNs in a column
num_nan_a = df.loc[ (pd.isna(df['a'])) , 'a' ].shape[0]
num_nan_b = df.loc[ (pd.isna(df['b'])) , 'b' ].shape[0]

# summarize the num_nan_b
print(df)
print(' ')
print(f"There are {num_nan_a} NaNs in column a")
print(f"There are {num_nan_b} NaNs in column b")

ให้เป็นเอาต์พุต:

     a    b
0  1.0  NaN
1  2.0  1.0
2  NaN  NaN

There are 1 NaNs in column a
There are 2 NaNs in column b

0

สมมติว่าคุณต้องการรับจำนวนค่าที่หายไป (NaN) ในคอลัมน์ (ชุดข้อมูล) ที่รู้จักในชื่อราคาใน dataframe ที่เรียกว่าบทวิจารณ์

#import the dataframe
import pandas as pd

reviews = pd.read_csv("../input/wine-reviews/winemag-data-130k-v2.csv", index_col=0)

ในการรับค่าที่หายไปโดยที่ n_missing_prices เป็นตัวแปรก็ทำได้ง่าย

n_missing_prices = sum(reviews.price.isnull())
print(n_missing_prices)

ผลรวมเป็นวิธีการสำคัญที่นี่พยายามใช้การนับก่อนที่ฉันจะรับรู้ผลรวมเป็นวิธีการที่เหมาะสมที่จะใช้ในบริบทนี้



-1

สำหรับงานของคุณคุณสามารถใช้ pandas.DataFrame.dropna ( https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.DataFrame.dropna.html ):

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame({'a': [1, 2, 3, 4, np.nan],
                   'b': [1, 2, np.nan, 4, np.nan],
                   'c': [np.nan, 2, np.nan, 4, np.nan]})
df = df.dropna(axis='columns', thresh=3)

print(df)

ด้วยพารามิเตอร์ thresh คุณสามารถประกาศจำนวนสูงสุดสำหรับค่า NaN สำหรับคอลัมน์ทั้งหมดใน DataFrame

รหัสผลลัพธ์:

     a    b
0  1.0  1.0
1  2.0  2.0
2  3.0  NaN
3  4.0  4.0
4  NaN  NaN
โดยการใช้ไซต์ของเรา หมายความว่าคุณได้อ่านและทำความเข้าใจนโยบายคุกกี้และนโยบายความเป็นส่วนตัวของเราแล้ว
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.