การสร้าง PNG ด้วย matplotlib เมื่อไม่แสดง DISPLAY

ฉันกำลังพยายามใช้ networkx กับ Python เมื่อฉันเรียกใช้โปรแกรมนี้จะได้รับข้อผิดพลาดนี้ มีอะไรหายไปหรือเปล่า

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

ฉันได้รับข้อผิดพลาดอื่นตอนนี้:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

ฉันได้รับข้อผิดพลาดอื่นตอนนี้:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

ปัญหาหลักคือว่า (ในระบบของคุณ) matplotlib เลือกแบ็กเอนด์ x โดยใช้เป็นค่าเริ่มต้น ฉันเพิ่งมีปัญหาเดียวกันบนเซิร์ฟเวอร์ตัวใดตัวหนึ่งของฉัน ทางออกสำหรับฉันคือการเพิ่มรหัสต่อไปนี้ในสถานที่ที่ได้รับการอ่านก่อนนำเข้าpylab / matplotlib / pyplot อื่น ๆ:

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

ทางเลือกคือการตั้งค่าใน. matplotlibrc ของคุณ

เช่นเดียวกับการเติมคำตอบของ Reinout

วิธีถาวรในการแก้ปัญหาประเภทนี้คือการแก้ไขไฟล์. matplotlibrc ค้นหาผ่าน

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

จากนั้นแก้ไขแบ็กเอนด์ในไฟล์backend : Aggนั้นเป็น อย่างนั้นแหละ.

คำตอบที่ชัดเจนคือการใช้เวลาเล็กน้อยในการเตรียมสภาพแวดล้อมในการดำเนินการของคุณอย่างถูกต้อง

เทคนิคแรกที่คุณต้องเตรียมสภาพแวดล้อมการดำเนินการของคุณคือการใช้matplotlibrcไฟล์ตามคำแนะนำอย่างชาญฉลาดโดยคริสคิว , การตั้งค่า

backend : Agg

ในไฟล์นั้น คุณสามารถควบคุมได้แม้ไม่มีการเปลี่ยนแปลงรหัส - วิธีและตำแหน่งที่ matplotlib ค้นหาและค้นหาmatplotlibrcไฟล์ไฟล์

เทคนิคที่สองที่คุณต้องเตรียมสภาพแวดล้อมการดำเนินการของคุณคือการใช้MPLBACKENDตัวแปรสภาพแวดล้อม (และแจ้งให้ผู้ใช้ของคุณเพื่อใช้ประโยชน์จากมัน):

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

สิ่งนี้มีประโยชน์เพราะคุณไม่ต้องให้ไฟล์อื่นบนดิสก์เพื่อใช้งานได้ ฉันได้ใช้วิธีการนี้กับตัวอย่างเช่นการทดสอบในการรวมอย่างต่อเนื่องและทำงานบนเครื่องระยะไกลที่ไม่มีจอแสดงผล

การเข้ารหัสแบ็กเอนด์ matplotlib ของคุณให้เป็น "Agg" ในรหัส Python ของคุณก็เหมือนกับการทุบหมุดสี่เหลี่ยมเข้าไปในรูกลมด้วยค้อนขนาดใหญ่เมื่อคุณสามารถบอก matplotlib ได้ว่าต้องเป็นรูสี่เหลี่ยม

ฉันพบข้อผิดพลาดขณะใช้ matplotlib ผ่าน Spark matplotlib.use('Agg')ไม่ได้ผลสำหรับฉัน ในที่สุดรหัสต่อไปนี้ใช้งานได้สำหรับฉัน เพิ่มเติมที่นี่

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

ฉันจะทำซ้ำสิ่งที่ @Ivo Bosticky พูดซึ่งสามารถมองข้ามได้ วางบรรทัดเหล่านี้ที่จุดเริ่มต้นVERYของไฟล์ py

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

หรือจะได้รับข้อผิดพลาด

* / usr / lib / pymodules / python2.7 / matplotlib / __ init__.py:923: UserWarning: การเรียกไปยัง matplotlib.use () นี้ไม่มีผลใด ๆ
เพราะแบ็กเอนด์ได้ถูกเลือกแล้ว;
matplotlib.use () ต้องเรียกว่า * ก่อน * pylab, matplotlib.pyplot, *

สิ่งนี้จะแก้ไขปัญหาการแสดงผลทั้งหมด

ฉันพบว่าข้อมูลโค้ดนี้ทำงานได้ดีเมื่อสลับระหว่างสภาพแวดล้อม X และ no-X

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

เมื่อลงชื่อเข้าใช้เซิร์ฟเวอร์เพื่อรันโค้ดให้ใช้สิ่งนี้แทน:

ssh -X username@servername

-Xจะได้รับการกำจัดของชื่อที่แสดงและไม่มีข้อผิดพลาด $ DISPLAY ตัวแปรสภาพแวดล้อม

:)

คุณใช้ระบบอะไร ดูเหมือนว่าคุณมีระบบที่มี X11 แต่ตัวแปรสภาพแวดล้อม DISPLAY ไม่ได้ตั้งค่าอย่างเหมาะสม ลองเรียกใช้คำสั่งต่อไปนี้จากนั้นเรียกใช้โปรแกรมของคุณอีกครั้ง:

export DISPLAY=localhost:0

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

มันใช้งานได้สำหรับฉัน

อีกสิ่งหนึ่งที่ควรตรวจสอบคือผู้ใช้ปัจจุบันของคุณได้รับอนุญาตให้เชื่อมต่อกับจอแสดงผล X หรือไม่ ในกรณีของฉันรูทไม่ได้รับอนุญาตให้ทำเช่นนั้นและ matplotlib ก็บ่นกับข้อผิดพลาดเดียวกัน

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

แหล่งที่มา: http://www.debian-administrator.org/articles/494 https://debian-administr.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

เพื่อให้แน่ใจว่ารหัสของคุณเป็นแบบพกพาใน Windows, Linux และ OSX และสำหรับระบบที่มีและไม่มีจอแสดงผลฉันขอแนะนำตัวอย่างข้อมูลต่อไปนี้:

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

เครดิต: https://stackoverflow.com/a/45756291/207661

สำหรับกลไกการเรียนรู้ของ Google Cloud Machine:

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

จากนั้นให้พิมพ์ไปที่ไฟล์:

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

และเพื่อสร้าง PDF:

multi_page(report_name)