วิธีทำให้ Conda และ Virtualenv ทำงานบน mac OS Catalina ได้อย่างไร

ก่อนหน้านี้ฉันใช้ Conda ทำงานได้อย่างราบรื่นบน Mojave แต่ฉันพบว่าการอัพเกรดเป็น Catalina จะย้ายโฟลเดอร์ "anaconda3" ไปยังเดสก์ท็อปของคุณ> รายการที่ย้าย> ความปลอดภัย> anaconda3 ดูเหมือนว่าการตั้งค่าความปลอดภัยของ Catalina อาจไม่อนุญาตให้แอปพลิเคชันติดตั้งโดยตรงภายใต้ไดเรกทอรีผู้ใช้อีกต่อไป

ฉันลองคำแนะนำที่นี่เขียนไว้ด้านล่าง:

สวัสดีฉันอาจมีทางออก

• คัดลอกโฟลเดอร์ anaconda3 ที่อยู่ในรายการที่ย้ายไปยัง / Users / myname /
• เปิด Terminal
• ป้อน: export PATH = '' / ผู้ใช้ / myname / anaconda3 / bin: $ PATH "
• ป้อน: conda init zsh

มันได้ผล! โชคดี!

แต่มันไม่ได้ผลสำหรับฉัน หลังจากที่conda init zshฉันได้รับ:

-bash: / Users / USER / anaconda3 / bin / conda: / anaconda3 / bin / python: ล่ามที่ไม่ดี: ไม่มีไฟล์หรือไดเรกทอรีดังกล่าว

ฉันจะเรียกใช้ Conda และทำงานอีกครั้งได้อย่างไรโดยไม่สูญเสียสภาพแวดล้อมเสมือนจริงทั้งหมดของฉัน ขอบคุณ!

ปรับปรุง

ฉันได้รับ Conda มาทำงานตามคำแนะนำของ @Ted Shaowang ซึ่งหมายความว่าconda env listจะแสดงสภาพแวดล้อมเสมือนจริงทั้งหมดที่สร้างผ่าน Conda

อย่างไรก็ตามฉันยังคงประสบปัญหาvirtualenvเนื่องจากฉันเปลี่ยนตำแหน่งไฟล์ anaconda3 ที่เป็นค่าเริ่มต้นจึงไม่พบ python

.virtualenvs/env/bin/pythonไม่พบไฟล์ปฏิบัติการของหลามที่ ฉันจำเป็นต้องทำการเปลี่ยนแปลงเพิ่มเติมvirtualenvหรือไม่เพื่อให้งูเหลือมทำงานได้เช่นกัน?

ฉันมีปัญหาเดียวกันที่แน่นอนและสิ่งนี้ใช้ได้กับฉัน:

หลังจากที่คุณย้ายอนาคอนดาจาก "รายการที่ย้าย" ไปยัง~/anaconda3แก้ไขบรรทัดแรกของ~/anaconda3/bin/condaไฟล์จาก#!/anaconda3/bin/pythonไป#!/Users/USERNAME/anaconda3/bin/pythonยังเพื่อสะท้อนการเปลี่ยนแปลง

ฉันอาจจะงดใช้โซลูชันข้างต้น นั่น~/anaconda3/binไดเรกทอรีมีจำนวนมาก runnables (ไม่ได้เป็นเพียงcondaหนึ่ง) ที่จะต้องมีการเปลี่ยนแปลงในทางคู่มือฉบับนี้ ตัวอย่างเช่นหากคุณไม่ทำการเปลี่ยนแปลงแบบเดียวกันคุณจะไม่สามารถเรียกใช้jupyter notebookอย่างใดอย่างหนึ่งได้ไม่ว่าจะจากbaseenvs อื่นหรือไม่ก็ตาม

คำแนะนำของฉัน: ลองรับไฟล์ข้อกำหนดสำหรับ envs เสมือนของคุณและทำการติดตั้งใหม่ คุณสามารถใช้pipreqsเพื่อรับข้อกำหนดที่ใช้สำหรับแต่ละโครงการ: https://www.idiotinside.com/2015/05/10/python-auto-generate-requirements-txt/

ไม่มีวิธีแก้ปัญหาใดที่จะทำงานได้อย่างสมบูรณ์โดยไม่แก้ไขรายการคำนำหน้าแบบฮาร์ดโค้ดในไฟล์ มีคำอธิบายที่ยาวขึ้นและการแก้ไขที่แนะนำที่https://www.anaconda.com/how-to-restore-anaconda-after-macos-catalina-update/

ในทางเทคนิคนี่เป็นการติดตั้งแอนนาคอนดาอีกครั้ง แต่ฉันกู้คืนคอนโดทั้งหมดของฉันดังนั้นหวังว่านี่จะเป็นทางออกที่ยอมรับได้!

นี่คือวิธีที่ฉันได้ทำงานกับ Catalina เมื่อไม่กี่นาทีที่ผ่านมา (ตอนนี้ใช้ z-shell): - ตรวจสอบการมีอยู่ของไดเรกทอรี "Relocated Items" บนเดสก์ท็อปของฉันและไดเรกทอรี "anaconda3" และเนื้อหาภายใน - สำรวจเข้าไป envs ไดเรกทอรีภายใต้ "anaconda3" และเปิดหน้าต่างค้นหาไว้ (ดูภาพหน้าจอ)

แล้ว:

• เปิด Terminal ใหม่ (z-shell)

• วิ่ง (ติดตั้งไปยัง / usr / local / anaconda3):

  ชงถังติดตั้งงูใหญ่

• หลังจากติดตั้งสำเร็จฉันเปิดไฟล์ ~ / .zshrc (สำหรับนามแฝง z-shell ของฉัน) และเพิ่มบรรทัดต่อไปนี้:

  ส่งออก PATH = "/ usr / local / anaconda3 / bin: $ PATH"

• บันทึกไฟล์ ~ / .zshrc ของฉันแล้วโหลดใหม่ด้วย:

  แหล่งที่มา ~ / .zshrc

• เพื่อตรวจสอบว่าคำสั่ง conda ทำงานได้ในตอนนี้ฉันวิ่ง:

  รายการ env conda

• สำหรับฉันนี่แสดงให้เห็นว่าฐาน env และนั่นก็คือ

• จากนั้นเปิด Finder ไปยังตำแหน่ง envs ใหม่: open / usr / local / anaconda3 / envs /

• ฉันลาก (ย้าย) envs เก่าทั้งหมดของฉันลงในโฟลเดอร์ envs ใหม่แล้ววิ่ง:

  รายการ env conda

และ envs เก่าทั้งหมดของฉันกลับมาแล้ว! :)

• อัปเดต PyCharm interpreter / พา ธ env ของฉันเพื่อสะท้อนตำแหน่งใหม่ของ envs เหล่านี้ (ต้องรีสตาร์ท PyCharm หลังจาก แต่ตอนนี้มันใช้งานได้!)
• DONE

ไม่แน่ใจว่านี่ถือว่าเป็นความคิดเห็นหรืออย่างน้อยก็เป็นคำตอบชั่วคราว แต่ฉันจะไม่พยายามแก้ไขปัญหาความเข้ากันได้ของ Catalina กับ Anaconda ในตอนนี้ ดูปัญหาGitHubนี้

ฉันมีปัญหาเดียวกันและสิ่งนี้ใช้ได้กับฉัน: วิธีแก้ไขของฉัน:

1. คัดลอก anaconda3 ของคุณจากโฟลเดอร์รายการที่ย้าย
2. วางในผู้ใช้ / ชื่อผู้ใช้ของคุณ
3. เปิดไฟล์ conda ใน anaconda3 / bin ด้วยเครื่องมือแก้ไขและแก้ไขบรรทัดแรก#!/anaconda3/bin/pythonเป็น#!/Users/YourUserName/anaconda3/bin/python
4. บันทึกและเรียกใช้ไฟล์ conda
5. เปิด Terminal
6. เรียกใช้สิ่งนี้: export PATH=''/Users/YourUserName/anaconda3/bin:$PATH"
7. วิ่ง conda init zsh

ฉันเกิดปัญหาเดียวกันและวิธีแก้ปัญหาต่อไปนี้ใช้ได้สำหรับฉันและนี่เป็นวิธีที่ง่ายที่สุด:

แทนที่จะยุ่งเกี่ยวกับการคัดลอกไฟล์ anaconda3 จากรายการที่ถูกย้ายไปยังไดเรกทอรีผู้ใช้ / ชื่อผู้ใช้ควรจะติดตั้งเวอร์ชันล่าสุดของตัวนำทาง anaconda จากเว็บไซต์ทางการ: https://www.anaconda.com/distribution/#macos

ในระหว่างการติดตั้งมันจะถามสิทธิ์บางอย่างซึ่งเป็นผลมาจากนโยบายความปลอดภัยของ Apple ใหม่ให้สิทธิ์พวกเขาและมันทำงานได้อย่างที่ควรหลังจากการติดตั้งใหม่นี้!

นี่คือสิ่งที่ได้ผลสำหรับฉัน

นี่คือไฟล์ส่วนหัวของฉัน (Catalina 10.15):

/Library/Developer/CommandLineTools/usr/include/c++/v1/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.14.sdk/usr/include/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.14.sdk/usr/include/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.14.sdk/System/Library/Frameworks/Kernel.framework/Versions/A/Headers/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.15.sdk/usr/include/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.15.sdk/usr/include/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX10.15.sdk/System/Library/Frameworks/Kernel.framework/Versions/A/Headers/sys/stdio.h

วิ่งsudo find /Library -name stdio.hเพื่อดูว่าคุณอยู่ที่ไหน

ไฟล์ส่วนหัว Mojave 10.14:

$ sudo find /Library -name stdio.h 
/Library/Developer/CommandLineTools/usr/include/c++/v1/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/sys/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/usr/include/stdio.h
/Library/Developer/CommandLineTools/SDKs/MacOSX.sdk/System/Library/Frameworks/Kernel.framework/Versions/A/Headers/sys/stdio.h

ดังจะเห็นได้ว่าตอนนี้ SDKs ถูกแบ่งออกเป็น MACOSX10.14 และ 10.15 ซึ่งแตกต่างจาก Mojave

TLDR

ดังนั้นนี่คือโฟลเดอร์ SDK ของฉันใน Catalina:

1. เปลี่ยนชื่อMacOSX.sdkเป็นMacOSX_orig.sdk
2. คลิกขวาที่ MacOSX10.14.sdk
3. ซ้ำ
4. เปลี่ยนชื่อโฟลเดอร์ซ้ำเป็น MacOSX.sdk

โครงสร้างโฟลเดอร์ของคุณควรมีลักษณะดังนี้:

อย่างนี้เราก็ใช้ OSX sdk เวอร์ชั่นก่อนหน้าเป็น sysroot หวังว่านี่จะช่วยได้