CUDA เข้ากันไม่ได้กับเวอร์ชัน gcc ของฉัน

Question 1

ฉันมีปัญหาในการรวบรวมตัวอย่างบางส่วนที่มาพร้อมกับ CUDA SDK ฉันได้ติดตั้งไดรเวอร์นักพัฒนาแล้ว (เวอร์ชัน 270.41.19) และชุดเครื่องมือ CUDA จากนั้นก็เป็น SDK (ทั้งเวอร์ชัน 4.0.17)

เริ่มแรกมันไม่ได้รวบรวมเลยให้:

error -- unsupported GNU version! gcc 4.5 and up are not supported!

ฉันพบบรรทัดที่รับผิดชอบใน 81: /usr/local/cuda/include/host_config.h และเปลี่ยนเป็น:

//#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 4)
#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 6)

จากจุดนั้นฉันมีเพียงไม่กี่ตัวอย่างที่จะรวบรวมมันหยุดด้วย:

In file included from /usr/include/c++/4.6/x86_64-linux-gnu/bits/gthr.h:162:0,
             from /usr/include/c++/4.6/ext/atomicity.h:34,
             from /usr/include/c++/4.6/bits/ios_base.h:41,
             from /usr/include/c++/4.6/ios:43,
             from /usr/include/c++/4.6/ostream:40,
             from /usr/include/c++/4.6/iterator:64,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/iterator/iterator_categories.h:38,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/device_ptr.h:26,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/device_malloc_allocator.h:27,
             from /usr/local/cuda/include/thrust/device_vector.h:26,
             from lineOfSight.cu:37:
/usr/include/c++/4.6/x86_64-linux-gnu/bits/gthr-default.h:251:1: error: pasting         "__gthrw_" and "/* Android's C library does not provide pthread_cancel, check for
`pthread_create' instead.  */" does not give a valid preprocessing token
make[1]: *** [obj/x86_64/release/lineOfSight.cu.o] Error 1

เนื่องจากตัวอย่างบางส่วนรวบรวมฉันคิดว่านี่ไม่ใช่ปัญหาไดรเวอร์ แต่ต้องมีบางอย่างเกี่ยวข้องกับเวอร์ชัน gcc ที่ไม่รองรับ การดาวน์เกรดไม่ใช่ตัวเลือกเนื่องจาก gcc4.6 มีทั้งระบบเป็นการพึ่งพา ณ จุดนี้ ...

Question 2

ดังที่ได้กล่าวไปแล้ว nvcc ขึ้นอยู่กับ gcc 4.4 เป็นไปได้ที่จะกำหนดค่า nvcc ให้ใช้ gcc เวอร์ชันที่ถูกต้องโดยไม่ต้องส่งผ่านพารามิเตอร์ของคอมไพเลอร์ใด ๆ โดยการเพิ่มซอฟต์ลิงก์ลงในไดเร็กทอรี bin ที่สร้างด้วยการติดตั้ง nvcc

ไดเร็กทอรีไบนารี cuda ดีฟอลต์ (ค่าเริ่มต้นในการติดตั้ง) คือ / usr / local / cuda / bin การเพิ่ม softlink ไปยัง gcc เวอร์ชันที่ถูกต้องจากไดเร็กทอรีนี้ก็เพียงพอแล้ว:

sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /usr/local/cuda/bin/gcc

Question 3

ไม่รองรับ gcc 4.5 และ 4.6 กับ CUDA - โค้ดจะไม่คอมไพล์และส่วนที่เหลือของ toolchain รวมถึง cuda-gdb จะทำงานไม่ถูกต้อง คุณไม่สามารถใช้งานได้และข้อ จำกัด นี้ไม่สามารถต่อรองได้

ทางออกเดียวของคุณคือติดตั้ง gcc 4.4 เวอร์ชันเป็นคอมไพเลอร์ที่สอง (การแจกแจงส่วนใหญ่จะอนุญาต) มีตัวเลือกเป็น nvcc --compiler-bindirซึ่งสามารถใช้เพื่อชี้ไปยังคอมไพเลอร์ทางเลือก สร้างโลคัลไดเร็กทอรีจากนั้นสร้างลิงก์สัญลักษณ์ไปยังไฟล์ปฏิบัติการเวอร์ชัน gcc ที่รองรับ ส่งผ่านโลคัลไดเร็กทอรีไปยัง nvcc ผ่าน--compiler-bindirตัวเลือกและคุณควรจะสามารถคอมไพล์โค้ด CUDA ได้โดยไม่ส่งผลกระทบต่อระบบที่เหลือของคุณ

แก้ไข :

โปรดทราบว่าคำถามและคำตอบนี้เกี่ยวข้องกับ CUDA 4

นับตั้งแต่มีการเขียนขึ้น NVIDIA ก็ยังคงขยายการสนับสนุนสำหรับ gcc เวอร์ชันหลัง ๆ ในการเปิดตัว CUDA toolchain ที่ใหม่กว่า

ตั้งแต่รุ่น CUDA 4.1 ตอนนี้รองรับ gcc 4.5 แล้ว ไม่รองรับ gcc 4.6 และ 4.7
ตั้งแต่รุ่น CUDA 5.0 ตอนนี้รองรับ gcc 4.6 แล้ว ไม่รองรับ gcc 4.7
ตั้งแต่รุ่น CUDA 6.0 ตอนนี้รองรับ gcc 4.7 แล้ว
ในรุ่น CUDA 7.0 นั้นรองรับ gcc 4.8 อย่างสมบูรณ์โดยรองรับ 4.9 บน Ubuntu 14.04 และ Fedora 21
ในรุ่น CUDA 7.5 นั้นรองรับ gcc 4.8 อย่างสมบูรณ์โดยรองรับ 4.9 บน Ubuntu 14.04 และ Fedora 21
ตั้งแต่ CUDA 8 รีลีส gcc 5.3 ได้รับการสนับสนุนอย่างสมบูรณ์บน Ubuntu 16.06 และ Fedora 23
ในรุ่น CUDA 9 gcc 6 ได้รับการสนับสนุนอย่างสมบูรณ์บน Ubuntu 16.04, Ubuntu 17.04 และ Fedora 25
CUDA 9.2 รีลีสเพิ่มการรองรับสำหรับ gcc 7
CUDA 10.1 รีลีสเพิ่มการรองรับสำหรับ gcc 8

ปัจจุบัน (ณ CUDA 10.1) ไม่มีการรองรับ gcc 9 ใน CUDA

โปรดทราบว่าเมื่อเร็ว ๆ นี้ NVIDIA ได้เพิ่มตารางที่มีประโยชน์มากที่นี่ซึ่งมีคอมไพเลอร์และเมทริกซ์ระบบปฏิบัติการที่รองรับสำหรับ CUDA รุ่นปัจจุบัน

Question 4

ตรวจสอบเวอร์ชัน GCC ที่รองรับสูงสุดสำหรับเวอร์ชัน CUDA ของคุณ:

 | CUDA version | max supported GCC version |
 |--------------|---------------------------|
 |      11      |             9             |
 |  10.1, 10.2  |             8             |
 |   9.2, 10.0  |             7             |
 |   9.0, 9.1   |             6             |
 |       8      |            5.3            |
 |       7      |            4.9            |
 |    5.5, 6    |            4.8            |
 |    4.2, 5    |            4.6            |
 |      4.1     |            4.5            |
 |      4.0     |            4.4            |

ตั้งค่า env var สำหรับเวอร์ชัน GCC นั้น ตัวอย่างเช่นสำหรับ CUDA 10.2:
```
 MAX_GCC_VERSION=8
```
ตรวจสอบให้แน่ใจว่าคุณได้ติดตั้งเวอร์ชันนั้นแล้ว:
```
 sudo apt install gcc-$MAX_GCC_VERSION g++-$MAX_GCC_VERSION
```
เพิ่ม symlinks ภายในโฟลเดอร์ CUDA:
```
 sudo ln -s /usr/bin/gcc-$MAX_GCC_VERSION /usr/local/cuda/bin/gcc 
 sudo ln -s /usr/bin/g++-$MAX_GCC_VERSION /usr/local/cuda/bin/g++
```
(หรือแทนที่/usr/local/cudaด้วยเส้นทางการติดตั้ง CUDA ของคุณหากไม่มี)

ดูกระทู้นี้ GitHub สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับตารางการทำงานร่วมกัน

Question 5

โซลูชันของ Gearoid Murphy ทำงานได้ดีขึ้นสำหรับฉันเนื่องจากบน distro ของฉัน (Ubuntu 11.10), gcc-4.4 และ gcc-4.6 อยู่ในไดเร็กทอรีเดียวกันดังนั้น --compiler-bindir จึงไม่ช่วย ข้อแม้เดียวคือฉันต้องติดตั้ง g ++ - 4.4 และ symlink ด้วย:

sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-4.4 /usr/local/cuda/bin/g++

Question 6

สำหรับ CUDA7.5 บรรทัดเหล่านี้ทำงาน:

sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.9 /usr/local/cuda/bin/gcc 
sudo ln -s /usr/bin/g++-4.9 /usr/local/cuda/bin/g++

Question 7

ดูวิธีการใช้ "ทางเลือกการอัปเดต"เพื่อแก้ไขปัญหานี้:

... หากคุณติดตั้ง gcc 4.6 คุณยังสามารถใช้คำสั่ง update-alternate เพื่อให้สามารถสลับระหว่างเวอร์ชันได้อย่างง่ายดาย สามารถกำหนดค่าได้ด้วย:
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.6 60 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-4.6 
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-4.7 40 --slave /usr/bin/g++ g++ /usr/bin/g++-4.7 
sudo update-alternatives --config gcc

Question 8

หากใช้cmakeสำหรับฉันไม่มีการแฮ็กในการแก้ไขไฟล์และการเชื่อมโยงใด ๆ ฉันจึงรวบรวมโดยใช้แฟล็กที่ระบุเวอร์ชัน gcc / g ++
cmake -DCMAKE_C_COMPILER=gcc-6 -DCMAKE_CXX_COMPILER=g++-6 ..

ทำงานอย่างมีเสน่ห์

Question 9

ในการแจกแจงส่วนใหญ่คุณมีความเป็นไปได้ที่จะติดตั้ง gcc และ g ++ เวอร์ชันอื่นข้างคอมไพเลอร์ล่าสุดเช่น gcc-4.7 นอกจากนี้ระบบบิวด์ส่วนใหญ่ยังทราบถึงตัวแปรสภาพแวดล้อมCCและCXXซึ่งให้คุณระบุคอมไพเลอร์ C และ C ++ อื่น ๆ ตามลำดับ ดังนั้นฉันขอแนะนำสิ่งต่างๆเช่น:

CC=gcc-4.4 CXX=g++-4.4 cmake path/to/your/CMakeLists.txt

สำหรับ Makefiles ควรมีวิธีที่คล้ายกัน ฉันไม่แนะนำให้ตั้งค่า symlink ที่กำหนดเองภายใน / usr / local เว้นแต่คุณจะรู้ว่าคุณกำลังทำอะไรอยู่

Question 10

สิ่งนี้ใช้ได้กับ fedora 23 ที่เก็บ gcc ที่เข้ากันได้จะแตกต่างกันเล็กน้อยตามเวอร์ชันของ fedora ของคุณ

หากคุณติดตั้งที่เก็บต่อไปนี้:

sudo yum install compat-gcc-34-c++-3.4.6-37.fc23.x86_64 compat-gcc-34-3.4.6-37.fc23.x86_64

ตอนนี้ให้สร้างซอฟต์ลิงค์ตามที่กล่าวไว้ข้างต้นโดยสมมติว่ามีโฟลเดอร์ cuda bin ของคุณอยู่ /usr/local/cuda/

sudo ln -s /usr/bin/gcc-34 /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-34 /usr/local/cuda/bin/g++

ตอนนี้คุณควรจะคอมไพล์ได้nvccโดยไม่มีข้อผิดพลาดเวอร์ชัน gcc

Question 11

โซลูชันของ Gearoid Murphy ทำงานได้อย่างมีเสน่ห์ สำหรับฉันฉันมีสองไดเรกทอรีสำหรับ cuda -

/usr/local/cuda 
/usr/local/cuda-5.0

ต้องเพิ่มซอฟต์ลิงก์ลงในไดเร็กทอรีที่ระบุไว้ด้านล่างเท่านั้น -

/usr/local/cuda

นอกจากนี้จำเป็นต้องมีทั้งซอฟต์ลิงก์ g ++ และ gcc ตามที่ SchighSchagh กล่าวไว้

Question 12

อีกวิธีหนึ่งในการกำหนดค่า nvcc เพื่อใช้ gcc เวอร์ชันเฉพาะ (ตัวอย่างเช่น gcc-4.4) คือการแก้ไขnvcc.profileและแก้ไขPATHเพื่อรวมพา ธ ไปยัง gcc ที่คุณต้องการใช้ก่อน

ตัวอย่างเช่น (gcc-4.4.6 ติดตั้งใน / opt):

PATH += /opt/gcc-4.4.6/lib/gcc/x86_64-unknown-linux-gnu/4.4.6:/opt/gcc-4.4.6/bin:$(TOP)/open64/bin:$(TOP)/share/cuda/nvvm:$(_HERE_):

ตำแหน่งของnvcc.profileแตกต่างกันไป แต่ควรอยู่ในไดเร็กทอรีเดียวกับที่เรียกใช้งานnvccเอง

นี่เป็นการแฮ็กเล็กน้อยเนื่องจากnvcc.profileไม่ได้มีไว้สำหรับการกำหนดค่าผู้ใช้ตามคู่มือ nvcc แต่เป็นโซลูชันที่ทำงานได้ดีที่สุดสำหรับฉัน

Question 13

CUDA หลังจากการปรับเปลี่ยนส่วนหัวบางส่วนที่เข้ากันได้กับ gcc4.7 และอาจเป็นเวอร์ชันที่สูงกว่า: https://www.udacity.com/wiki/cs344/troubleshoot_gcc47

Question 14

สำหรับคนอย่างผมที่ทำให้เกิดความสับสนในขณะที่ใช้cmakeในสคริปต์แทนที่บางสิ่งจากFindCUDA.cmake nvcc.profileคุณสามารถระบุnvccคอมไพเลอร์เป็นเจ้าภาพโดยการตั้งค่าCUDA_HOST_COMPILERตามhttp://public.kitware.com/Bug/view.php?id=13674

Question 15

ฉันต้องติดตั้ง gcc, g ++ เวอร์ชันเก่ากว่า

    sudo apt-get install gcc-4.4
    sudo apt-get install g++-4.4

ตรวจสอบว่า gcc-4.4 อยู่ใน / usr / bin / และเหมือนกันสำหรับ g ++ จากนั้นฉันสามารถใช้วิธีแก้ปัญหาด้านบน:

    sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /opt/cuda/bin/gcc
    sudo ln -s /usr/bin/g++-4.4 /opt/cuda/bin/g++

Question 16

ใน$CUDA_HOME/include/host_config.hค้นหาบรรทัดเหล่านี้ (อาจแตกต่างกันเล็กน้อยระหว่าง CUDA เวอร์ชันต่างๆ):

//...
#if __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 9)

#error -- unsupported GNU version! gcc versions later than 4.9 are not supported!

#endif [> __GNUC__ > 4 || (__GNUC__ == 4 && __GNUC_MINOR__ > 9) <]
//...

ลบหรือเปลี่ยนแปลงให้ตรงกับเงื่อนไขของคุณ

โปรดทราบว่าวิธีนี้อาจไม่ปลอดภัยและอาจทำให้บิวด์ของคุณเสียหายได้ ตัวอย่างเช่น gcc 5 ใช้ C ++ 11 เป็นค่าเริ่มต้นอย่างไรก็ตามนี่ไม่ใช่กรณีสำหรับ nvcc ตาม CUDA 7.5 วิธีแก้ปัญหาคือการเพิ่ม

--Xcompiler="--std=c++98" สำหรับ CUDA <= 6.5

หรือ

--std=c++11 สำหรับ CUDA> = 7.0

Question 17

หากคุณพบข้อผิดพลาดนี้โปรดอ่านไฟล์บันทึก:

$ cat /var/log/cuda-installer.log 
[INFO]: Driver installation detected by command: apt list --installed | grep -e nvidia-driver-[0-9][0-9][0-9] -e nvidia-[0-9][0-9][0-9]
[INFO]: Cleaning up window
[INFO]: Complete
[INFO]: Checking compiler version...
[INFO]: gcc location: /usr/bin/gcc

[INFO]: gcc version: gcc version 9.2.1 20191008 (Ubuntu 9.2.1-9ubuntu2) 

[ERROR]: unsupported compiler version: 9.2.1. Use --override to override this check.

เพียงทำตามคำแนะนำในไฟล์บันทึก:

sudo sh cuda_<version>_linux.run --override

งานเสร็จแล้ว :)

ฉันเพิ่งติดตั้ง CUDA 10.2 พร้อม gcc 9.2 บน Kubuntu 19.10 โดยใช้--overrideตัวเลือก

Question 18

ในการรวบรวมตัวอย่าง CUDA 8.0 บน Ubuntu 16.10 ฉันทำ:

sudo apt-get install gcc-5 g++-5
cd /path/to/NVIDIA_CUDA-8.0_Samples
# Find the path to the library (this should be in NVIDIA's Makefiles)
LIBLOC=`find /usr/lib -name "libnvcuvid.so.*" | head -n1 | perl -pe 's[/usr/lib/(nvidia-\d+)/.*][$1]'`
# Substitute that path into the makefiles for the hard-coded, incorrect one
find . -name "*.mk" | xargs perl -pi -e "s/nvidia-\d+/$LIBLOC/g"
# Make using the supported compiler
HOST_COMPILER=g++-5 make

สิ่งนี้มีข้อดีของการไม่แก้ไขทั้งระบบหรือสร้าง symlink ให้เป็นเพียงไบนารี (ซึ่งอาจทำให้เกิดปัญหาในการเชื่อมโยงไลบรารี)

Question 19

สิ่งนี้ช่วยแก้ปัญหาของฉัน:

sudo rm /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo rm /usr/local/cuda/bin/g++
sudo apt install gcc-4.4 g++-4.4
sudo ln -s /usr/bin/gcc-4.4 /usr/local/cuda/bin/gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-4.4 /usr/local/cuda/bin/g++

Question 20

สำหรับ CUDA 6.5 (และเห็นได้ชัดว่าเป็น 7.0 และ 7.5) ฉันได้สร้างแพ็คเกจ gcc 4.8.5 RPM (ภายใต้ Fedora Core 30) ที่อนุญาตให้ติดตั้ง gcc เวอร์ชันนั้นควบคู่ไปกับ GCC ปัจจุบันของระบบของคุณ

คุณสามารถค้นหาข้อมูลทั้งหมดที่นี่

Question 21

ในกรณีของฉันฉันติดตั้ง CUDA จากเวอร์ชัน Ubuntu แล้วและ cmake จะตรวจพบสิ่งนั้นแทนที่จะเป็นเวอร์ชันที่ติดตั้งใหม่โดยใช้ NVidia SDK Manager

ฉันวิ่ง dpkg -l | grep cudaและสามารถดูทั้งสองเวอร์ชัน

สิ่งที่ฉันต้องทำคือถอนการติดตั้ง CUDA เก่า (เวอร์ชัน 9.1 ในกรณีของฉัน) และปล่อยเวอร์ชันใหม่ไว้คนเดียว (เวอร์ชัน 10.2) ฉันใช้คำสั่ง purge ดังนี้:

sudo apt-get purge libcudart9.1 nvidia-cuda-dev nvidia-cuda-doc \
                                nvidia-cuda-gdb nvidia-cuda-toolkit

โปรดตรวจสอบว่าชื่อแพ็กเกจตรงกับเวอร์ชันที่คุณต้องการลบออกจากการติดตั้งของคุณ

ฉันต้องรันใหม่cmakeจากBUILDไดเร็กทอรีว่างเพื่อเปลี่ยนเส้นทาง#includeและไลบรารีทั้งหมดไปยังเวอร์ชัน SDK (เนื่องจากพา ธ เก่าถูกอบในสภาพแวดล้อมการสร้างที่มีอยู่)

Question 22

สิ่งนี้เกิดขึ้นเนื่องจากเวอร์ชัน CUDA ปัจจุบันของคุณไม่รองรับเวอร์ชัน GCC ปัจจุบันของคุณ คุณต้องดำเนินการดังต่อไปนี้:

ค้นหาเวอร์ชัน GCC ที่รองรับ (ในกรณีของฉันคือ 5 สำหรับ CUDA 9)
- CUDA 4.1: GCC 4.5
- CUDA 5.0: GCC 4.6
- CUDA 6.0: GCC 4.7
- CUDA 7.0: GCC 4.8
- CUDA 7.5: GCC 4.8
- CUDA 8: GCC 5.3
- CUDA 9: GCC 5.5
- CUDA 9.2: GCC 7
- CUDA 10.1: GCC 8
ติดตั้ง GCC เวอร์ชันที่รองรับ
```
sudo apt-get install gcc-5
sudo apt-get install g++-5
```
เปลี่ยนซอฟต์ลิงก์สำหรับ GCC ใน/usr/binไดเร็กทอรี
```
cd /usr/bin
sudo rm gcc
sudo rm g++
sudo ln -s /usr/bin/gcc-5 gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-5 g++
```
เปลี่ยนซอฟต์ลิงก์สำหรับ GCC ใน/usr/local/cuda-9.0/binไดเร็กทอรี
```
cd /usr/local/cuda-9.0/bin
sudo rm gcc
sudo rm g++
sudo ln -s /usr/bin/gcc-5 gcc
sudo ln -s /usr/bin/g++-5 g++
```

เพิ่ม-DCUDA_HOST_COMPILER=/usr/bin/gcc-5ลงในsetup.pyไฟล์ของคุณใช้สำหรับการคอมไพล์

if torch.cuda.is_available() and CUDA_HOME is not None:
    extension = CUDAExtension
    sources += source_cuda
    define_macros += [("WITH_CUDA", None)]
    extra_compile_args["nvcc"] = [
        "-DCUDA_HAS_FP16=1",
        "-D__CUDA_NO_HALF_OPERATORS__",
        "-D__CUDA_NO_HALF_CONVERSIONS__",
        "-D__CUDA_NO_HALF2_OPERATORS__",
        "-DCUDA_HOST_COMPILER=/usr/bin/gcc-5"
    ]

ลบไดเร็กทอรี build เก่า
```
rm -rd build/
```
คอมไพล์อีกครั้งโดยตั้งค่า CUDAHOSTCXX=/usr/bin/gcc-5
```
CUDAHOSTCXX=/usr/bin/gcc-5 python setup.py build develop
```

หมายเหตุ: หากคุณยังคงได้รับgcc: error trying to exec 'cc1plus': execvp: no such file or directoryข้อผิดพลาดหลังจากทำตามขั้นตอนเหล่านี้แล้วให้ลองติดตั้ง GCC ใหม่เช่นนี้แล้วรวบรวมอีกครั้ง:

sudo apt-get install --reinstall gcc-5
sudo apt-get install --reinstall g++-5

เครดิต: https://github.com/facebookresearch/maskrcnn-benchmark/issues/25#issuecomment-433382510