คำถามติดแท็ก density-functional-theory

โดยเฉพาะฉันต้องการขยายงานที่เกี่ยวข้องกับ B3LYP ที่เริ่มต้นด้วย Gaussian 03 แต่ดำเนินการต่อด้วย GAMESS-US พลังงานที่มีให้โดยวิธี B3LYP เริ่มต้นไม่เหมือนกัน มีการอภิปรายเกี่ยวกับเรื่องนี้ในคู่มือ GAMESS-US (ส่วนข้อมูลเพิ่มเติม): โปรดทราบว่า B3LYP ใน GAMESS นั้นมีพื้นฐานมาจากฟังก์ชันความสัมพันธ์ของแก๊สอิเล็กตรอน VWN5 เนื่องจากมีห้าสูตรด้วยสองพารามิเตอร์ที่เป็นไปได้ที่กล่าวถึงในกระดาษ VWN เกี่ยวกับความสัมพันธ์ในพื้นที่โปรแกรมอื่นอาจใช้ตัวเลือกอื่น ๆ และดังนั้นจึงสร้างพลังงาน B3LYP ที่แตกต่างกัน ตัวอย่างเช่นคู่มือของ NWChem กล่าวว่าใช้ฟังก์ชัน "VWN 1 กับพารามิเตอร์ RPA ซึ่งตรงข้ามกับพารามิเตอร์ Monte Carlo ที่กำหนด" เป็นค่าเริ่มต้น หากคุณต้องการใช้สูตร VWN1 นี้ในไฮบริด B3LYP เพียงเลือก "DFTTYP = B3LYP1" มีข้อความระบุว่าค่าเริ่มต้นจะแตกต่างกันระหว่าง GAMESS และ NWCHEM …

15 computational-chemistry  density-functional-theory 

ในทางทฤษฎีแล้วเวลาที่ใช้ในการคำนวณขนาดความหนาแน่นของทฤษฎีการทำงาน (DFT) กับจำนวนอิเล็กตรอนเป็นอย่างไร ฉันสนใจการใช้งาน DFT แบบ "ปกติ" เช่น VASP, ABINIT และอื่น ๆ ไม่ใช่รหัส O (N)

11 density-functional-theory 

ฉันกำลังใช้การจำลองน้ำโมเลกุลเพื่อการทดสอบ กล่องมีขนาดค่อนข้างเล็กถ้าคุณถามผู้ชายที่ใช้ MD คลาสสิคและค่อนข้างใหญ่ถ้าคุณถามผู้ชาย DFT: ฉันมี 58 โมเลกุลของน้ำในเงื่อนไขขอบเขตเป็นระยะ เพื่อเป็นการประหยัดเวลาของ CPU ฉันได้ปรับเซลล์ของฉันด้วยฟิลด์บังคับแบบคลาสสิกก่อนเรียกใช้ ab initio MD ฉันปรับระบบให้เป็นแบบคลาสสิกที่ 300K เป็นเวลา 1 ns จากนั้นจึงถ่ายภาพสุดท้ายและใช้เป็นอินพุตสำหรับ ab initio MD ab initio MD ของฉันคือ MD-Born-Oppenheimer ที่ใช้พื้นฐาน DFT ที่มีชุดคลื่นระนาบพื้นฐานและศักยภาพ PAW (หลอก) (VASP เป็นรหัส) ในการจำลองทั้งแบบดั้งเดิมและแบบ ab ฉันกำลังรักษาอุณหภูมิคงที่ที่ 300K โดยใช้เทอร์โมสแตชชิ่งที่ช่วยลดความเร็ว ฉันสำรวจสองวิธีที่แตกต่างกันเพื่อให้การเปลี่ยนระหว่างแบบคลาสสิคและแบบเริ่มต้น ab: ใช้ความเร็วและตำแหน่งเริ่มต้นจากวิถีดั้งเดิมและนำเข้าเป็นค่าเริ่มต้นสำหรับการจำลอง ab initio ตรึงระบบไว้ที่อุณหภูมิศูนย์เพื่อรักษาตำแหน่งคลาสสิกนำเข้าที่รหัส DFT จากนั้นอย่างรวดเร็ว (ฉันกำลังทำใน 0.5 …

9 molecular-dynamics  density-functional-theory