R: การสุ่มฟอเรสต์การโยน NaN / Inf ในข้อผิดพลาด“ การเรียกฟังก์ชันต่างประเทศ” แม้จะไม่มีชุดข้อมูลของ NaN [ปิด]

29

ฉันใช้คาเร็ตเพื่อรันฟอเรสต์แบบสุ่มที่ผ่านการตรวจสอบความถูกต้องข้ามชุดข้อมูล ตัวแปร Y เป็นปัจจัย ไม่มีชุดข้อมูลของ NaN, Inf's หรือ NA ในชุดข้อมูลของฉัน อย่างไรก็ตามเมื่อใช้ป่าสุ่มฉันได้รับ

Error in randomForest.default(m, y, ...) : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)
In addition: There were 28 warnings (use warnings() to see them)
Warning messages:
1: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion
2: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion
3: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion
4: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion

ไม่มีใครมีความคิดที่ว่าข้อผิดพลาดนี้เกิดจากการบังคับของ NA หรือไม่? ถ้าเป็นเช่นนั้นฉันจะป้องกันการข่มขู่อย่างไร

r random-forest caret regression prediction fitting social-science poisson-distribution distributions characteristic-function bayesian prior regression normal-distribution interaction nonparametric skewness svm standard-deviation standard-error regression-coefficients igraph natural-language word2vec word-embeddings regression machine-learning sampling r regression machine-learning random-forest ensemble sampling unbiased-estimator proof estimators mse probability conditional-probability bayes anova missing-data neural-networks recommender-system r confidence-interval sample multiple-imputation r time-series forecasting mase

— Info5ek
แหล่งที่มา

36

ต้องมีคุณสมบัติบางอย่างในชุดการฝึกอบรมของคุณด้วยคลาส 'char'

กรุณาตรวจสอบเรื่องนี้

> a <- c("1", "2",letters[1:5], "3")
> as.numeric(a)
[1]  1  2 NA NA NA NA NA  3
Warning message:
NAs introduced by coercion

— Pankaj Sharma
แหล่งที่มา

เพียงแค่เพิ่ม - ถ้าคุณสมบัติเป็นหมวดหมู่จริง ๆ แล้วมันยังสามารถรวมอยู่ด้วยการแปลงเป็นปัจจัยเช่น blah <-as.factor (blah)

— P.Windridge

14

สาเหตุอาจเป็นเพราะคุณมีตัวแปรตัวละครบางตัวในกรอบข้อมูลของคุณ

แปลงตัวแปรอักขระทั้งหมดเป็นแฟคเตอร์ในหนึ่งบรรทัด:

library(dplyr) data_fac=data_char %>% mutate_if(is.character, as.factor)

— pablo_sci
แหล่งที่มา

2

ฉันไม่ได้คิดที่จะใช้mutate_if()สิ่งนี้ ... ขอบคุณ!

— Andrew Br Andrewza

3

ดังที่แสดงในคำเตือนมีข้อผิดพลาด 28 ข้อซึ่งเกิดขึ้นเป็นจำนวนคอลัมน์ที่มีประเภทข้อมูลอักขระ ("chr") การบังคับคอลัมน์เหล่านี้ให้อยู่ในปัจจัยที่อนุญาตให้เริ่มต้นได้

— Info5ek
แหล่งที่มา