ธันเดอร์เบิร์ดในฐานะไคลเอนต์อีเมลมีคุณสมบัติของโฟลเดอร์การค้นหาที่บันทึกซึ่งทำงานเป็นโฟลเดอร์เสมือน โฟลเดอร์การค้นหาสามารถแนบที่ใดก็ได้ในลำดับชั้นของกล่องจดหมายจริงเพื่อให้สามารถจัดระเบียบได้เป็นอย่างดี นี้จะช่วยให้คุณออกจากอีเมลของคุณทั้งหมดในกล่องจดหมายหนึ่งที่เป็นเพียงความจริงแบ่งออกเป็นโฟลเดอร์
ดูบทความนี้: วิธีการจัดระเบียบจดหมายยืดหยุ่นการใช้โฟลเดอร์เสมือนใน Mozilla Thunderbird
หากต้องการเพิ่มโครงสร้างคล้ายกับ Gmail โปรดดูที่การเพิ่มการค้นหาต่อเนื่องไปยัง Gmail ใช้ส่วนขยายGreasemonkey Firefox พร้อมกับสคริปต์ผู้ใช้นี้ มันเพิ่มช่อง "การค้นหา" ที่ด้านซ้ายใต้ "ป้ายกำกับ" และ "เชิญเพื่อน" ที่การคลิกที่การค้นหาจะดำเนินการกับแบบสอบถามที่บันทึกไว้ อย่างไรก็ตามนี่ไม่ใช่วิธีการที่ยืดหยุ่นเช่นเดียวกับเมื่อใช้ธันเดอร์เบิร์ด