ข้อแตกต่างที่ใหญ่จริงๆระหว่างการติดตั้งสิ่งต่าง ๆ จาก Software Center หรือ gui อื่นและการทำมันจากบรรทัดคำสั่งคือเมื่อสิ่งผิดปกติ
ใน guis ส่วนใหญ่ข้อความแสดงข้อผิดพลาดในการติดตั้งจะถูกซ่อนไว้และพวกเขาจะให้ข้อความทั่วไปว่าไม่ได้ผล เมื่อคุณทำจากบรรทัดคำสั่งคุณจะเห็นข้อความทั้งหมดที่สร้างขึ้น บ่อยครั้งที่ข้อมูลนี้สามารถใช้เพื่อแก้ไขปัญหาหรือจะแจ้งให้คุณทราบสาเหตุที่คุณไม่ต้องการแก้ไข เช่นการติดตั้งแพคเกจจะทำให้แตกหรือถอนการติดตั้งแพ็คเกจอื่น ๆ ที่ติดตั้งไว้แล้ว
บางครั้งแพคเกจล้มเหลวในการติดตั้งเพียงเพราะหนึ่งในการพึ่งพาไม่ได้ติดตั้ง (และการติดตั้งปกติไม่ได้แก้ไขโดยอัตโนมัติเหมือนที่ทำส่วนใหญ่) เมื่อสิ่งนี้เกิดขึ้นคุณมักจะสามารถติดตั้งแพ็คเกจที่ขาดหายไปก่อนจากนั้นการติดตั้งของคุณจะสำเร็จ
apt-get จะแจ้งให้คุณทราบถึงแพ็คเกจที่เกี่ยวข้องอื่น ๆ ที่ "แนะนำ" พร้อมกับแพ็คเกจของคุณเพื่อให้คุณสามารถค้นหาและดูว่าคุณต้องการหรือไม่
นอกจากนี้ยังรายงานเกี่ยวกับแพ็คเกจที่ติดตั้งไว้ก่อนหน้านี้ซึ่งอาจไม่ต้องการอีกต่อไปและบอกวิธีลบออก
คุณไม่ควรเพิ่ม / ลบแพ็คเกจจากสองขั้นตอนเหล่านี้โดยไม่ตรวจสอบแพ็คเกจที่เกี่ยวข้องอย่างรอบคอบ แต่โดยทั่วไปจะปลอดภัย
ใน Ubuntu 12.04 แอพที่ติดตั้งใหม่จะถูกเพิ่มเข้าไปในตัวเรียกใช้งานตามค่าเริ่มต้น แต่สิ่งนี้จะเกิดขึ้นกับแอพที่ติดตั้งโดยใช้ Software Center เท่านั้น