จะติดตั้ง numpy และ scipy สำหรับ python ได้อย่างไร

ฉันเหนื่อยที่จะลองติดตั้ง numpy and scipy สำหรับ phyton 2.7.5 ฉันต้องการ python เวอร์ชั่นนี้เพราะเป้าหมายสุดท้ายของฉันคือการติดตั้งคลาส ( http://class-code.net/ ) และ montepython ( http: // montepython .net / )

(ฉันมี Ubuntu 12.04)

เมื่อฉันพยายามนำเข้า numpy หรือ scipy ฉันได้รับข้อผิดพลาดต่อไปนี้ทุกครั้ง:

$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined        symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
  from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

เพื่อกำจัดข้อผิดพลาดฉันได้ลอง:

1. ตอบสนองความต้องการของหลาม: $ sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran
2. ติดตั้งด้วย apt-get: $ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose
3. ติดตั้งความต้องการด้วย pip: $ sudo pip install requests
4. ... และพยายามติดตั้งด้วย pip: $ sudo pip install numpyและ$ sudo pip install scipy
5. ฉันมีสภาพแวดล้อม var: export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH} ครั้งสุดท้ายที่ฉันติดตั้ง numpy และ scipy (ใน Ubuntu รุ่นเก่า 10.x) สิ่งนี้ใช้ได้สำหรับฉัน

6. sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python" sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python" จากนั้นติดตั้งทั้งคู่ด้วย pip เช่นเดียวกับใน (4)

   แต่ตอนนี้ดูเหมือนว่าเซิร์ฟเวอร์ของpython-distribute.orgไม่ทำงาน ฉันได้รับข้อผิดพลาดต่อไปนี้:

   http://python-distribute.org/distribute_setup.py
   Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known.
   wget: unable to resolve host address `python-distribute.org'
   

7. ฉันยังพยายามติดตั้ง numpy และ scipy จากศูนย์ซอฟต์แวร์ synaptic และ Ubuntu

ฉันล้มเหลวในการพยายามแต่ละครั้งและตอนนี้ฉันไม่รู้จะทำอย่างไร ฉันพลาดอะไรไปรึเปล่า? ฉันจะติดตั้ง numpy และ scipy ให้ถูกต้องสำหรับไพ ธ อนได้อย่างไร? ความคิดใด ๆ ที่จะได้รับการชื่นชม

เมื่อฉันทำ

echo $PYTHONPATH

ฉันเข้าใจ

/usr/lib/python2.7/dist-packages

ตกลงให้ทำตามคำแนะนำในการติดตั้ง :

1. มันบอกว่าคุณต้องการ python 2.7 (ซึ่งคุณมีอยู่แล้ว):

   $ python --version
   Python 2.7.4
   

2. ถ้าอย่างนั้นก็บอกว่าคุณต้องการแพ็คเกจ numpy ด้วย, รุ่น> = 1.4.1:

   นโยบาย apt-cache python-numpy
   หลาม numpy:
   ติดตั้งแล้ว: (ไม่มี)
   ผู้สมัคร: 1: 1.7.1-1ubuntu1
   ตารางเวอร์ชัน:
    1: 1.7.1-1ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main amd64 แพ็คเกจ

   อย่างที่คุณเห็นฉันมี numpy version 1.7.1 ดังนั้นให้ทำการติดตั้งต่อไป:

   sudo apt-get install python-numpy

3. ตอนนี้มันบอกว่าเราต้องการ cython ลองตรวจสอบว่าแพ็คเกจนั้นมีประโยชน์หรือไม่:

   apt-cache policy cython
   Cython:
   ติดตั้งแล้ว: (ไม่มี)
   ผู้สมัคร: 0.17.4-0ubuntu1
   ตารางเวอร์ชัน:
    0.17.4-0ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main amd64 แพ็คเกจ

   เรามีมันเราติดตั้งมัน:

   sudo apt-get install cython

   โปรดสังเกตว่ามีแพ็คเกจอื่น ๆ ที่ขึ้นต่อกันที่ติดตั้งอยู่ด้วย

4. ผิดปกติพอเราต้องการโมดูล scipy ด้วย:

   sudo apt-get install python-scipy

5. การทดสอบ เปิด python ในเทอร์มินัลแล้วพิมพ์ต่อไปนี้:

   $ python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) 
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> import numpy
   >>> import scipy
   >>> import cython
   >>> exit()
   

   ข้างต้นจะต้องไม่มีข้อผิดพลาด หากมีข้อผิดพลาดขึ้นไปและอ่านคู่มืออีกครั้งคุณลืม / ข้ามขั้นตอน

6. การดาวน์โหลดแหล่งข้อมูล CLASS จากหน้าเว็บของพวกเขาไปที่ไดเรกทอรีในเทอร์มินัลแล้วนำมันออกและยกเลิกการสร้าง:

   cd โดยที่ / the / tar / คือ
   tar zxf class_v2.0.2.tar.gz
   cd class_v2.0.2
   แต่งหน้า

   ที่นี่เราจะรอจนกว่าจะเสร็จสมบูรณ์ เมื่อเสร็จแล้วเราไปที่ไดเรกทอรีหลามและเริ่มเวทย์มนตร์ หากไม่ย้ายจากไดเรกทอรีให้ทำสิ่งนี้:

   หลาม cd
   หลาม setup.py บิวด์
   หลาม setup.py ติดตั้ง --user

   ตอนนี้เรามี CLASS ติดตั้งในไดเรกทอรีผู้ใช้ของเรา เราควรทดสอบมัน!

   python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26)
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> from classy import Class
   >>> exit()
   

   ทุกอย่างเป็นเรื่องที่แสนสบายจนมาถึงที่นี่

7. ตอนนี้เวลาจริงดาวน์โหลด monthypython tarball ในไดเรกทอรีรหัสของคุณ:

   cd ~
   รหัส mkdir
   รหัสซีดี
   wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5.tar.bz2
   tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2

   ในคำแนะนำในการติดตั้งมีหมายเหตุบางประการที่ไม่เกี่ยวข้องในกรณีพิเศษนี้ (การติดตั้งใหม่) แต่อาจมีความสำคัญเมื่อคุณอัปเดต montepython

8. การเปลี่ยนแปลงนี้มีความสำคัญ คุณจำตำแหน่งที่ติดตั้งคลาสได้หรือไม่ ตอนนี้คุณควรบอก Monte Python ว่าอยู่ที่ไหน ในกรณีของฉันมันเป็นของ/home/braiam/src/class_v2.0.2/classคุณอาจแตกต่างกัน คุณสามารถใช้findเพื่อค้นหา:

   find ~ -name class -print

   ตอนนี้ฉันจะแก้ไขdefault.confไฟล์โดยใช้สิ่งที่คุณชอบ (ฉันจะใช้นาโน) และแก้ไขrootพา ธ ดังนั้นไฟล์ที่สมบูรณ์จะมีลักษณะดังนี้:

   # Fill in the relevant path to your personal distribution. 
   # If you create a new file out of this one, please remember to call
   # MontePython.py with the option '-conf my.conf'
   
   # At minimum, this file should contain one line:
   # ** path['cosmo'] =  path to the cosmological code you are using. Note, if you are
   # using a modified version of class, be sure that the path contains the word
   # class, otherwise the code might not recognise it.
   
   # If you want to use a data folder different from the one present in the folder
   # you are executing the code, please also add:
   # ** path['data']  =  /path/to/the/other/data/
   
   root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/'
   
   path['cosmo']           = root+'/class/'
   

   บันทึกไฟล์และออก

9. ทดสอบ montepython! หากทุกอย่างเรียบร้อยคุณควรจะสามารถเรียกใช้code/MontePython.py --helpในไดเรกทอรี montepythong ของคุณและทุกอย่างควรทำงาน:

   ~ / src / montepython $ code / MontePython.py --help
   การใช้งาน: MontePython.py [-h] [-N จำนวนขั้นตอน] [-o โฟลเดอร์ออก]
                     [-p ไฟล์พารามิเตอร์อินพุต] [-c อินพุตโควิเมทริกซ์]
                     [-j กระโดดวิธี] [-f กระโดดปัจจัย]
                     [-conf ไฟล์การกำหนดค่า] [-chain_number หมายเลขโซ่]
                     [-r รีสตาร์ทจากลูกโซ่] [-bf รีสตาร์ทจากไฟล์ที่ดีที่สุด]
                     [-info [ข้อมูลการคำนวณของไฟล์ที่ต้องการ [ข้อมูลการคำนวณของไฟล์ที่ต้องการ ... ]]]
                     [-bins จำนวนถังขยะที่ต้องการค่าเริ่มต้นคือ 20] [-no_mean]
                     [- เปรียบเทียบโฟลเดอร์]
                     [-extra plot file สำหรับความต้องการที่กำหนดเอง] [-noplot] [-all]
                     [นามสกุลข้อความเปลี่ยนแปลงสำหรับไฟล์เอาต์พุต]
                     [-fontsize ขนาดอักษรที่ต้องการค่าเริ่มต้นคือ 15]
                     [-ticksize ticksize ที่ต้องการเริ่มต้นคือ 13]
   
   Monte Python รหัส Monte Carlo ใน Python
   
   
   อาร์กิวเมนต์ตัวเลือก:
   -h, - ช่วยแสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก
   จำนวนขั้นตอน -N
   -o โฟลเดอร์เอาท์พุท
   ไฟล์ p- พารามิเตอร์การป้อนข้อมูล
   -c cov เมทริกซ์อินพุต
   วิธีการกระโดด -j
   ปัจจัยการกระโดด
   ไฟล์การกำหนดค่า -conf
   -chain_number หมายเลขโซ่
   -r เริ่มจากเชน
   -bf รีสตาร์ทจากไฟล์ที่เหมาะสมที่สุด
   -info [ข้อมูลการคำนวณของไฟล์ที่ต้องการ [ข้อมูลการคำนวณของไฟล์ที่ต้องการ ... ]]
   จำนวนที่ต้องการของถังขยะเริ่มต้นคือ 20
   -no_mean
   - เปรียบเทียบโฟลเดอร์
   -extra plot file สำหรับความต้องการที่กำหนดเอง
   -noplot
   พัก
   ส่วนขยายการเปลี่ยนแปลงถัดไปสำหรับไฟล์เอาต์พุต
   - ขนาดตัวอักษรที่ต้องการแบบอักษรเริ่มต้นคือ 15
   -ticksize ticksize ที่ต้องการเริ่มต้นคือ 13

ด้วยสิ่งนี้คุณได้ติดตั้ง montepython และพร้อมลุย!