จะนับจำนวนตัวอักษรในหนึ่งบรรทัดได้อย่างไรยกเว้นอักขระที่ระบุ

นี่คือไฟล์ส่วนหนึ่ง

N W N N N N N N N N N
N C N N N N N N N N N
N A N N N N N N N N N
N N N N N N N N N N N
N G N N N N N N N N N
N C N N N C N N N N N
N C C N N N N N N N N

ในแต่ละบรรทัดฉันต้องการนับจำนวนอักขระทั้งหมดที่ไม่ใช่ "N"

ความปรารถนาของฉันออก

1
1
1
0
1
2
2

GNU awk solution:

awk -v FPAT='[^N[:space:]]' '{ print NF }' file

• FPAT='[^N[:space:]]'- รูปแบบการกำหนดค่าของฟิลด์ (ตัวอักษรใด ๆ ยกเว้นNถ่านและช่องว่าง)

ผลลัพธ์ที่คาดหวัง:

1
1
1
0
1
2
2

awk '{ gsub("[ N]",""); print length() }'

สมมติว่าจำเป็นต้องมีการนับสำหรับแต่ละบรรทัดนอกเหนือจากอักขระช่องว่างและ N

$ perl -lne 'print tr/N //c' ip.txt 
1
1
1
0
1
2
2

• ค่าส่งคืนของtrคือจำนวนอักขระที่ถูกแทนที่
• c เพื่อเติมเต็มชุดของอักขระที่กำหนด
• สังเกตการใช้-lตัวเลือกตัดอักขระขึ้นบรรทัดใหม่จากบรรทัดอินพุตเพื่อหลีกเลี่ยงข้อผิดพลาดแบบออฟไลน์และเพิ่มอักขระขึ้นบรรทัดใหม่สำหรับคำสั่งพิมพ์

ทางออกทั่วไปมากขึ้น

perl -lane 'print scalar grep {$_ ne "N"} @F' ip.txt 

• -aตัวเลือกเพื่อแยกบรรทัดอินพุตโดยอัตโนมัติในพื้นที่สีขาวบันทึกใน@Fอาร์เรย์
• grep {$_ ne "N"} @Fส่งคืนอาร์เรย์ขององค์ประกอบทั้งหมด@Fที่ไม่ตรงกับสตริงN
  • regex เทียบเท่าจะเป็น grep {!/^N$/} @F
• การใช้scalarจะให้จำนวนองค์ประกอบของอาร์เรย์

โซลูชันawkทางเลือก:

awk '{ print gsub(/[^N[:space:]]/,"") }' file

• gsub(...)- gsub()ฟังก์ชั่นคืนค่าจำนวนของการทดแทนที่ทำ

ผลลัพธ์:

1
1
1
0
1
2
2

awkวิธีอื่น(จะคืนค่า -1สำหรับบรรทัดว่าง)

awk -F'[^N ]' '$0=NF-1""' infile

หรือในคอมเพล็กซ์ก็จะส่งคืน-1ในบรรทัดว่างเปล่า0ในช่องว่าง (แท็บ / ช่องว่าง) เท่านั้น

awk -F'[^N \t]+' '$0=NF-1""' infile

1. trและเชลล์สคริปต์POSIX :

   tr -d 'N ' < file | while read x ; do echo ${#x} ; done
   

2. bash, kshและzsh:

   while read x ; do x="${x//[ N]}" ; echo ${#x} ; done < file
   

ชุดสั้น ๆ ของtrและawk:

$ tr -d ' N' <file.in | awk '{ print length }'
1
1
1
0
1
2
2

การทำเช่นนี้จะเป็นการเว้นช่องว่าง Ns ทั้งหมดจากไฟล์อินพุตและawkเพียงพิมพ์ความยาวของแต่ละบรรทัด

อีกวิธีที่ง่ายคือทำใน python ซึ่งติดตั้งมาล่วงหน้าในสภาพแวดล้อมของยูนิกซ์ส่วนใหญ่ วางรหัสต่อไปนี้ในไฟล์. py:

with open('geno') as f:
    for line in f:
        count = 0
        for word in line.split():
            if word != 'N':
                count += 1
        print(count)

แล้วทำ:

python file.py

จากสถานีของคุณ สิ่งที่ทำข้างต้นคือ:

• สำหรับแต่ละบรรทัดในไฟล์ชื่อ "geno"
• ตั้งค่าตัวนับเป็น 0 และเพิ่มขึ้นทุกครั้งที่เราหาค่า! = 'N'
• เมื่อถึงจุดสิ้นสุดของบรรทัดปัจจุบันให้พิมพ์ตัวนับและไปที่บรรทัดถัดไป