คำถามติดแท็ก bioinformatics

ฉันชอบ file1: 0 AFFX-SNP-000541 NA 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 rs12103 0.6401 1 rs12103_1247494 0.696 1 rs12142199 0.7672 และไฟล์ 2: 0 AFFX-SNP-000541 1 0 AFFX-SNP-002255 1 1 rs12103 0.5596 1 rs12103_1247494 0.5581 1 rs12142199 0.4931 และต้องการไฟล์ 3 เช่นนั้น: 0 AFFX-SNP-000541 NA 1 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 1 rs12103 0.6401 0.5596 1 …

33 text-processing  awk  join  bioinformatics 

ฉันมีโฟลเดอร์ที่มีไฟล์จำนวนมาก (xyz1, xyz2 ไปจนถึง xyz5025) และฉันต้องเรียกใช้สคริปต์ในทุก ๆ ไฟล์รับ xyz1.faa, xyz2.faa และอื่น ๆ คำสั่งสำหรับไฟล์เดียวคือ: ./transeq xyz1 xyz1.faa -table 11 มีวิธีการทำเช่นนั้นโดยอัตโนมัติหรือไม่? อาจจะเป็นคำสั่งผสมที่ต้องทำ?

19 shell-script  text-processing  files  scripting  bioinformatics 

ตามที่เป็นอยู่ในปัจจุบันคำถามนี้ไม่เหมาะสำหรับรูปแบบคำถาม & คำตอบของเรา เราคาดหวังคำตอบที่จะได้รับการสนับสนุนจากข้อเท็จจริงการอ้างอิงหรือความเชี่ยวชาญ แต่คำถามนี้อาจเรียกร้องให้มีการถกเถียงอภิปรายโต้แย้งหรือการอภิปรายเพิ่มเติม หากคุณรู้สึกว่าคำถามนี้สามารถปรับปรุงและเปิดใหม่ได้โปรดไปที่ศูนย์ช่วยเหลือเพื่อขอคำแนะนำ ปิดให้บริการใน6 ปีที่ผ่านมา ฉันเพิ่งซื้อแล็ปท็อปเครื่องใหม่เพื่อใช้สำหรับการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เมื่อฉันอยู่ที่บ้าน เครื่องมีโปรเซสเซอร์ Intel i7 ที่มี 8 คอร์, RAM 4 GB และการ์ดกราฟิกจาก Nvidia (2 GB, Ivy Bridge) โปรแกรมที่ฉันต้องการใช้ในการคำนวณมากที่สุดคือ MATLAB และ Python ฉันพยายามติดตั้ง Ubuntu (รุ่น 12.10 และ 13.04) และพวกเขาทั้งสองช้า เมื่อ MATLAB ใช้ 1 คอร์ 100% ทั้งระบบปฏิบัติการจะค้าง ไม่สามารถทำอะไรได้ในเวลาเดียวกัน นอกจากนี้การ์ดกราฟิกนั้นไม่ได้ใช้อย่างเต็มประสิทธิภาพ (ฉันใช้ optirun หรือให้ค่าสถานะ DRI_PRIME เมื่อเริ่มต้นโปรแกรม) และไม่ได้ใช้โดย …

19 linux  distribution-choice  bioinformatics 

นี่คือไฟล์ส่วนหนึ่ง N W N N N N N N N N N N C N N N N N N N N N N A N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N N G N N N …

9 text-processing  bioinformatics