คำถามติดแท็ก join

ฉันชอบ file1: 0 AFFX-SNP-000541 NA 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 rs12103 0.6401 1 rs12103_1247494 0.696 1 rs12142199 0.7672 และไฟล์ 2: 0 AFFX-SNP-000541 1 0 AFFX-SNP-002255 1 1 rs12103 0.5596 1 rs12103_1247494 0.5581 1 rs12142199 0.4931 และต้องการไฟล์ 3 เช่นนั้น: 0 AFFX-SNP-000541 NA 1 0 AFFX-SNP-002255 NA 1 1 rs12103 0.6401 0.5596 1 …

33 text-processing  awk  join  bioinformatics 

ฉันมีสองไฟล์ _jeter3.txt และ _jeter1.txt ฉันได้ตรวจสอบพวกเขาทั้งสองเรียงในคอลัมน์ที่ 20 ใช้ sort -c sort -t ' ' -c -k20,20 _jeter3.txt sort -t ' ' -c -k20,20 _jeter1.txt #no errors แต่มีข้อผิดพลาดเมื่อฉันต้องการjoinไฟล์ทั้งสองมันบอกว่าไฟล์ที่สองไม่ได้เรียง: join -t ' ' -1 20 -2 20 _jeter1.txt _jeter3.txt > /dev/null join: File 2 is not in sorted order ฉันไม่เข้าใจว่าทำไม cat /etc/*-release #FYI …

13 sort  join 

File1.txt id No gi|371443199|gb|JH556661.1| 7907290 gi|371443198|gb|JH556662.1| 7573913 gi|371443197|gb|JH556663.1| 7384412 gi|371440577|gb|JH559283.1| 6931777 File2.txt id P R S gi|367088741|gb|AGAJ01056324.1| 5 5 0 gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 gi|367090281|gb|AGAJ01054784.1| 4 4 0 gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 output.txt id P R S NO gi|371443198|gb|JH556662.1| 2 2 0 7573913 gi|371440577|gb|JH559283.1| 21 19 2 6931777 File1.txt มีสองคอลัมน์ …

11 awk  join 

ฉันจะถามคำถามของฉันพร้อมตัวอย่าง ฉันมี 2 ไฟล์: ไฟล์ # 1: 118D FC300_R5_TP FX.B 32775 2112 6 2038 6 2112 0 118E FC300_R5_TP FX.B 32775 2136 7 2065 6 2136 0 118F FC300_R5_TP FX.B 32775 2124 6 2064 6 2124 0 1190 FC300_R5_TP FX.B 819210 814632 99 814609 99 814632 0 1191 FC300_R5_TP FX.B …

9 shell-script  text-processing  awk  join 

ฉันมีสองไฟล์ที่มีรายการประมาณ 12900 และ 4400 ตามลำดับที่ฉันต้องการเข้าร่วม ไฟล์ดังกล่าวมีข้อมูลตำแหน่งสำหรับสถานีสำรวจสภาพอากาศที่มีที่ดินเป็นฐานทั่วโลก ไฟล์ที่ใหญ่ที่สุดจะได้รับการอัพเดตทุกสองสัปดาห์และมีขนาดเล็กลงปีละครั้งหรือมากกว่านั้น สามารถดูไฟล์ต้นฉบับได้ที่นี่ ( http://www.wmo.int/pages/prog/www/ois/volume-a/vola-home.htmและ http://weather.rap.ucar.edu/surface/ สถานี . txt ) ไฟล์ที่ฉันมีอยู่แล้วถูกจัดการโดยฉันด้วย awk, sed, และ bash script บางตัว ฉันใช้ไฟล์เพื่อให้เห็นภาพข้อมูลโดยใช้แพ็คเกจ GEMPAK ซึ่งสามารถใช้งานได้อย่างอิสระจาก Unidata ไฟล์ที่ใหญ่ที่สุดจะทำงานกับ GEMPAK แต่จะไม่สามารถทำงานได้อย่างเต็มประสิทธิภาพ สำหรับการเข้าร่วมนี้เป็นสิ่งจำเป็น ไฟล์ 1 มีข้อมูลตำแหน่งสำหรับสถานีตรวจสอบสภาพอากาศโดยที่ตัวเลข 6 ตัวแรกคือตัวระบุสถานีที่ไม่ซ้ำกัน พารามิเตอร์ที่แตกต่างกัน (หมายเลขสถานีชื่อสถานีรหัสประเทศละติจูดลองจิจูดและระดับความสูงของสถานี) จะถูกกำหนดโดยตำแหน่งในบรรทัดเท่านั้นนั่นคือไม่มีแท็บ 060090 AKRABERG FYR DN 6138 -666 101 060100 VAGA FLOGHAVN DN 6205 …

9 shell-script  text-processing  awk  columns  join