ปัญหาบางอย่างในด้านชีววิทยาการคำนวณดูเหมือนจะเหมาะสำหรับการใช้งานจริงที่ไม่ใช่ของเทียม - หรืออย่างน้อยก็ไม่เป็นของประดิษฐ์ตามปัญหาที่ Jukka Suomela พูดถึง
ตัวอย่างเช่นผู้คนมักพูดถึงงานของ F. Abu-Khzam, R. Collins, M. Fellows, M. Langston, W. Suters C. Symons, อัลกอริทึม Kernelization สำหรับปัญหา Vertex Cover: ทฤษฎีและการทดลอง , การดำเนินการของ 6 การประชุมเชิงปฏิบัติการเกี่ยวกับวิศวกรรมอัลกอริทึมและการทดลอง (ALENEX), ACM / SIAM, Proc คณิตศาสตร์ประยุกต์ 115, 2004
ในฐานะผู้เขียนกล่าวว่า "หนึ่งในแอปพลิเคชันที่เราใช้วิธีการของเรานั้นเกี่ยวข้องกับการค้นหาต้นไม้สายวิวัฒนาการจากข้อมูลโดเมนโปรตีน ... " (ส่วนที่ 8 ของกระดาษด้านบน)
ส่วนย่อยของผู้เขียนมีเอกสารที่คล้ายกันในหัวข้อนี้ดูเช่น Faisal N. Abu-Khzam, Michael A. Langston, Pushkar Shanbhag และ Christopher T. Symons, อัลกอริทึมขนานที่ปรับขนาดได้สำหรับปัญหา FPT , Algorithmica, Volume 45, Number 3 , 269-284
ฉันไม่แน่ใจว่าอินสแตนซ์ที่ใช้ในการทดสอบนั้นเป็นอินสแตนซ์จริงหรือของเทียม แต่ฉันหวังว่าการอ้างอิงทั้งสองจะให้จุดเริ่มต้นที่ดีแก่คุณ