คำถามติดแท็ก phylogeny

ฉันเข้าใจว่าได้ค่าความแปรปรวนร่วมจากข้อมูลวิวัฒนาการทางพันธุกรรมเพื่อสร้างสำหรับตัวแปรสองตัวที่คุณกำลังทำการถดถอย แต่จะเกิดอะไรขึ้นถ้าคุณมีตัวแปรต่อเนื่องหนึ่งตัวซึ่งก่อนหน้านี้คุณได้แสดงให้เห็นว่าขึ้นอยู่กับไฟโตจีนีและตัวแปรอันดับหนึ่ง ลำดับหลังเป็นลำดับฉันไม่แน่ใจว่าจะเชื่อมโยงสิ่งนี้กับวิธีที่การพึ่งพาอาศัยสายวิวัฒนาการทำให้เกิดสถิติการทดสอบแบบเอนเอียงc o v ( X), วาย) = 0cov(X,Y)=0cov(X,Y) = 0 มันมีความหมายหรือไม่ที่จะคำนวณ Phylogenetic Independent Contrasts อิสระของ Felsenstein กับตัวแปรต่อเนื่องของคุณและใช้สำหรับ ANOVA ของคุณ? ค่า PIC คือ: คฉันเจ= ( Xผม- XJ)dฉันเจ--√Cij=(Xi−Xj)dijC_{ij} = \frac{(X_i - X_j)}{\sqrt{d_{ij}}} โดยที่คือXสำหรับสปีชีส์I , X jคือXสำหรับสปีชีส์j , และd i jคือระยะห่างระหว่างสปีชีส์iและjบนต้นไม้สายวิวัฒนาการXผมXiX_iXXXฉัน, XJi,Xji, X_jXXXJjjdฉันเจdijd_{ij}ผมiiJjj

13 anova  phylogeny 

ในสายวิวัฒนาการต้นไม้ phylogenetic มักถูกสร้างขึ้นโดยใช้ MLE หรือการวิเคราะห์แบบเบย์ อาจเกิดการแบนก่อนใช้ในการประเมินแบบเบย์ ตามที่ฉันเข้าใจแล้วการประมาณการแบบเบย์เป็นการประมาณการความเป็นไปได้ที่จะรวมเอาการประเมินก่อนหน้านี้ คำถามของฉันคือถ้าคุณใช้ความคิดก่อนหน้านี้มันแตกต่างจากการวิเคราะห์ความน่าจะเป็นหรือไม่?

9 bayesian  confidence-interval  maximum-likelihood  likelihood  phylogeny