โดยไม่คำนึงถึงชนิดช็อคโกแลตทั้งหมดควรเก็บไว้ในที่เย็นและความชื้นต่ำ (แห้ง) วางให้ห่างจากแสงแดดโดยตรง มันจะเป็นการดีที่สุดที่จะผนึกมันไว้ในภาชนะที่แน่นหนาเพราะอย่างที่ ElendiTheTall กล่าวว่าเนยโกโก้จะดูดซับรสชาติ
ดาร์กช็อกโกแลตจะคงอยู่นานหลายปี นมและช็อคโกแลตขาวจะคงอยู่ในระยะเวลาอันสั้น (ไม่กี่เดือน) เนื่องจากปริมาณน้ำนม
ช็อคโกแลตที่เก็บไว้อย่างไม่เหมาะสมจะทำให้เกิดดอกซึ่งแสดงเป็นลายสีขาวหรือสีเทาหรือจุดบนพื้นผิว การสังเกตหรือลายเป็นเนยโกโก้ไขมันแยกและเป็นสัญญาณว่าอารมณ์ของช็อคโกแลตได้หายไป ช็อคโกแลตชนิดนี้ยังเหมาะสำหรับการใช้งานทุกประเภทที่ช็อคโกแลตจะถูกละลายอย่างสมบูรณ์ (การอบส่วนใหญ่) มันยังสามารถใช้เป็นช็อกโกแลตฐาน (ไม่ใช่เมล็ด) สำหรับแบ่งเบาบรรเทาด้วยวิธีการเพาะ แต่ไม่ควรใช้สำหรับการทำขนมอื่น ๆ