วิธีหนึ่งในการเก็บรักษาเมล็ด kefir เป็นระยะเวลานานถึง 2 เดือนคือการแช่แข็งเมล็ดสำรอง
ในการแช่แข็งอย่างมีประสิทธิภาพให้ล้างเมล็ดธัญพืชด้วยน้ำที่ผ่านกระบวนการต้ม ซับแห้งระหว่างการเช็ดด้วยผ้าเช็ดตัวสีขาวที่ผ่านการรีดเย็นแล้วเพื่อขจัดความชื้นส่วนเกิน
วางเมล็ดในขวดหรือในถุงพลาสติกปิดผนึกและใส่ในช่องแช่แข็ง ด้วยนมผงอันดับแรกให้เพิ่มนมผงแห้ง [DMP] เพิ่มพอที่จะครอบคลุมธัญพืชด้วย DMP ขวดผนึกหรือถุงแล้วแช่แข็ง
DMP นั้นถูกผสมกับ kefir-milk ในฐานะสาร cryoprotectant เพื่อป้องกันการไหม้ของช่องแช่แข็ง แม้ว่าฉันจะพบว่าเมล็ด kefir นั้นใช้ได้นานถึงหนึ่งปีด้วยวิธีนี้ระยะเวลานี้อาจลบส่วนประกอบของยีสต์ที่พบในเมล็ด kefir ที่มีสุขภาพสมบูรณ์ [ถ้าแช่แข็งนานกว่า 2 เดือน แต่ไม่เจาะจง] ด้วยศักยภาพนี้ทำให้การแช่แข็งเมล็ด kefir ดังที่อธิบายไว้ข้างต้นจึงทำได้ดีที่สุดเป็นระยะเวลาไม่เกิน 2 เดือน
หากไม่ได้ระบุ DMP สำหรับการแช่แข็ง kefir-grain ดังนั้นขอแนะนำให้ใช้ระยะเวลาไม่เกิน 1 เดือน มิฉะนั้นส่วนประกอบของยีสต์ของเมล็ด kefir อาจเสียหายได้โดยเฉพาะอย่างยิ่งถ้าละลายและแช่แข็งบางส่วนอย่างต่อเนื่องเนื่องจากกลไกการแช่แข็งไม่ดี
หากต้องการเปิดใช้งานเมล็ด kefir ที่แช่แข็งอีกครั้งให้ละลายโดยวางธัญพืชในแก้วที่เต็มไปด้วยน้ำเย็นสักสองสามนาที วางเมล็ดลงในเครื่องกรองและล้างนมผงที่ติดอยู่กับเมล็ดด้วยน้ำเย็น http://users.sa.chariot.net.au/~dna/Makekefir.html#Storing_kefir-grains