คำถามติดแท็ก lme4-nlme

lme4 และ nlme เป็นแพ็คเกจ R ที่ใช้สำหรับแบบจำลองเชิงเส้นแบบเชิงเส้นแบบเชิงเส้นและแบบไม่เชิงเส้นที่เหมาะสม สำหรับคำถามทั่วไปเกี่ยวกับแบบผสมให้ใช้แท็ก [แบบผสม]

1
ฉันจะตีความความแปรปรวนของเอฟเฟกต์แบบสุ่มได้อย่างไรในโมเดลผสมแบบเส้นตรงทั่วไป
ในโลจิสติกส์แบบจำลองเชิงเส้นผสมแบบเชิงเส้นทั่วไป (ครอบครัว = ทวินาม) ฉันไม่รู้วิธีตีความความแปรปรวนของผลกระทบแบบสุ่ม: Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. HOSPITAL (Intercept) 0.4295 0.6554 Number of obs: 2275, groups: HOSPITAL, 14 ฉันจะตีความผลลัพธ์ที่เป็นตัวเลขนี้ได้อย่างไร ฉันมีตัวอย่างของผู้ป่วยไตวายเรื้อรังในการศึกษาแบบหลายศูนย์ ฉันกำลังทดสอบว่าความน่าจะเป็นของผู้ป่วยที่ได้รับการรักษาด้วยยาลดความดันโลหิตเฉพาะนั้นเหมือนกันระหว่างศูนย์หรือไม่ สัดส่วนของผู้ป่วยที่รักษาแตกต่างกันอย่างมากระหว่างศูนย์ แต่อาจเกิดจากความแตกต่างในลักษณะพื้นฐานของผู้ป่วย ดังนั้นฉันจึงประมาณแบบจำลองเชิงเส้นผสมแบบทั่วไป (โลจิสติก) ปรับสำหรับคุณสมบัติหลักของผู้ป่วย นี่คือผลลัพธ์ที่ได้: Generalized linear mixed model fit by maximum likelihood ['glmerMod'] Family: binomial ( logit ) Formula: HTATTO ~ AGE + …
9 r  lme4-nlme 

1
การทดสอบ anova type III สำหรับ GLMM
ฉันเหมาะสมกับglmerโมเดลในlme4แพ็กเกจ R ฉันกำลังมองหาตารางโนวาที่มีค่า p แสดงอยู่ในนั้น แต่ฉันไม่สามารถหาแพ็คเกจที่เหมาะกับมันได้ เป็นไปได้ไหมที่จะทำใน R? แบบจำลองที่ฉันเหมาะสมอยู่ในรูปแบบ: model1<-glmer(dmn~period*teethTreated+(1|fullName), family="poisson", data=subset(dataset, group=='Four times a year'), control=glmerControl(optimizer="bobyqa"))

1
จะเปรียบเทียบเหตุการณ์ที่สังเกตได้กับเหตุการณ์ที่คาดหวังได้อย่างไร
สมมติว่าฉันมีตัวอย่างหนึ่งความถี่ของเหตุการณ์ที่เป็นไปได้ 4 เหตุการณ์: Event1 - 5 E2 - 1 E3 - 0 E4 - 12 และฉันมีโอกาสที่จะเกิดเหตุการณ์ที่คาดหวัง: p1 - 0.2 p2 - 0.1 p3 - 0.1 p4 - 0.6 ด้วยผลรวมของความถี่ที่สังเกตได้จากเหตุการณ์ทั้งสี่ของฉัน (18) ฉันสามารถคำนวณความถี่ที่คาดหวังของเหตุการณ์ได้ใช่ไหม expectedE1 - 18 * 0.2 = 3.6 expectedE2 - 18 * 0.1 = 1.8 expectedE1 - 18 * 0.1 …
9 r  statistical-significance  chi-squared  multivariate-analysis  exponential  joint-distribution  statistical-significance  self-study  standard-deviation  probability  normal-distribution  spss  interpretation  assumptions  cox-model  reporting  cox-model  statistical-significance  reliability  method-comparison  classification  boosting  ensemble  adaboost  confidence-interval  cross-validation  prediction  prediction-interval  regression  machine-learning  svm  regularization  regression  sampling  survey  probit  matlab  feature-selection  information-theory  mutual-information  time-series  forecasting  simulation  classification  boosting  ensemble  adaboost  normal-distribution  multivariate-analysis  covariance  gini  clustering  text-mining  distance-functions  information-retrieval  similarities  regression  logistic  stata  group-differences  r  anova  confidence-interval  repeated-measures  r  logistic  lme4-nlme  inference  fiducial  kalman-filter  classification  discriminant-analysis  linear-algebra  computing  statistical-significance  time-series  panel-data  missing-data  uncertainty  probability  multivariate-analysis  r  classification  spss  k-means  discriminant-analysis  poisson-distribution  average  r  random-forest  importance  probability  conditional-probability  distributions  standard-deviation  time-series  machine-learning  online  forecasting  r  pca  dataset  data-visualization  bayes  distributions  mathematical-statistics  degrees-of-freedom 

1
ทำไมการแนะนำของเอฟเฟกต์ความชันแบบสุ่มทำให้ SE ของความชันเพิ่มขึ้น
ฉันพยายามวิเคราะห์ผลกระทบของปีต่อตัวแปร logInd สำหรับกลุ่มบุคคลโดยเฉพาะ (ฉันมี 3 กลุ่ม) โมเดลที่ง่ายที่สุด: > fix1 = lm(logInd ~ 0 + Group + Year:Group, data = mydata) > summary(fix1) Call: lm(formula = logInd ~ 0 + Group + Year:Group, data = mydata) Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -5.5835 -0.3543 -0.0024 0.3944 4.7294 Coefficients: Estimate Std. Error …

2
ฉันระบุรุ่น lmer ของฉันถูกต้องหรือไม่
ฉัน scoured Google และเว็บไซต์นี้และฉันยังคงสับสนเกี่ยวกับฟังก์ชัน lmer ในไลบรารี lme4 ฉันมีข้อมูลบางอย่างที่เก็บรวบรวมจากหอผู้ป่วยจิตเวชที่แตกต่างกันซึ่งมีโครงสร้างหลายระดับ เพื่อให้ง่ายขึ้นฉันจะเลือกตัวแปรสองระดับ 2 และสองระดับ 1 แม้ว่าฉันจะมีอีกไม่กี่ตัว Level 2- WardSize [นี่คือจำนวนผู้คนในวอร์ด] & WAS [นี่คือการวัดความดี "วอร์ด" ของวอร์ด] ตัวแปรการจัดกลุ่มที่บอก R ว่าใครในวอร์ดเรียกว่า "วอร์ด" ระดับหนึ่ง - เพศ [นี่คือเพศชัดเจน] & BSITotal [นี่คือการวัดความรุนแรงของอาการ] ผลลัพธ์คือ Selfreject ซึ่งอีกครั้งคือสิ่งที่ดูเหมือน ฉันมีสูตรนี้: ความช่วยเหลือ = lmer (สูตร = Selfreject ~ WardSize + WAS + เพศ + …

2
คำนวณ ROC curve สำหรับข้อมูล
ดังนั้นฉันมีการทดลอง 16 ครั้งที่ฉันพยายามพิสูจน์ตัวตนบุคคลจากลักษณะทางชีวภาพโดยใช้ Hamming Distance เกณฑ์ของฉันถูกตั้งไว้ที่ 3.5 ข้อมูลของฉันอยู่ด้านล่างและเฉพาะการทดลองใช้ 1 เท่านั้นคือ True Positive: Trial Hamming Distance 1 0.34 2 0.37 3 0.34 4 0.29 5 0.55 6 0.47 7 0.47 8 0.32 9 0.39 10 0.45 11 0.42 12 0.37 13 0.66 14 0.39 15 0.44 16 0.39 จุดสับสนของฉันคือฉันไม่แน่ใจจริงๆเกี่ยวกับวิธีสร้าง ROC curve …
9 mathematical-statistics  roc  classification  cross-validation  pac-learning  r  anova  survival  hazard  machine-learning  data-mining  hypothesis-testing  regression  random-variable  non-independent  normal-distribution  approximation  central-limit-theorem  interpolation  splines  distributions  kernel-smoothing  r  data-visualization  ggplot2  distributions  binomial  random-variable  poisson-distribution  simulation  kalman-filter  regression  lasso  regularization  lme4-nlme  model-selection  aic  r  mcmc  dlm  particle-filter  r  panel-data  multilevel-analysis  model-selection  entropy  graphical-model  r  distributions  quantiles  qq-plot  svm  matlab  regression  lasso  regularization  entropy  inference  r  distributions  dataset  algorithms  matrix-decomposition  regression  modeling  interaction  regularization  expected-value  exponential  gamma-distribution  mcmc  gibbs  probability  self-study  normality-assumption  naive-bayes  bayes-optimal-classifier  standard-deviation  classification  optimization  control-chart  engineering-statistics  regression  lasso  regularization  regression  references  lasso  regularization  elastic-net  r  distributions  aggregation  clustering  algorithms  regression  correlation  modeling  distributions  time-series  standard-deviation  goodness-of-fit  hypothesis-testing  statistical-significance  sample  binary-data  estimation  random-variable  interpolation  distributions  probability  chi-squared  predictor  outliers  regression  modeling  interaction 
โดยการใช้ไซต์ของเรา หมายความว่าคุณได้อ่านและทำความเข้าใจนโยบายคุกกี้และนโยบายความเป็นส่วนตัวของเราแล้ว
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.